53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3404 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3404  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0411  hypothetical protein  62.32 
 
 		 71 aa  90.1  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3681  hypothetical protein  63.77 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0122929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3506  hypothetical protein  63.77 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00012483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  62.32 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0459  hypothetical protein  61.76 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0487  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000002687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0466  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000739571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3853  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000215717  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0446  hypothetical protein  62.32 
 
 		 70 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00475096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0490  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000900641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0542  hypothetical protein  60.87 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0502225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3391  hypothetical protein  55.07 
 
 		 71 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000297352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0459  hypothetical protein  57.53 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4510  hypothetical protein  57.35 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  46.97 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  46.27 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  44.12 
 
 		 70 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  44.29 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  40.3 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2221  protein of unknown function DUF465  43.06 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.322461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1604  hypothetical protein  43.06 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1507  hypothetical protein  43.06 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2234  hypothetical protein  43.06 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01394  hypothetical protein  43.06 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1749  hypothetical protein  43.06 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297536  hitchhiker  6.336410000000001e-19 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01383  hypothetical protein  43.06 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2120  hypothetical protein  43.28 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1650  hypothetical protein  43.06 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2030  hypothetical protein  41.79 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171486  hitchhiker  0.0000000000000487786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  41.79 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  38.81 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2236  hypothetical protein  46.88 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  35.21 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0499  hypothetical protein  35.21 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.132623  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0474  hypothetical protein  35.21 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0709  hypothetical protein  44.78 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0974  hypothetical protein  36.62 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196541  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2075  hypothetical protein  38.81 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0910666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1796  hypothetical protein  38.81 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0906  hypothetical protein  36 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  32.84 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1031  conserved hypothetical protein (DUF465 domain protein)  36.62 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1610  protein of unknown function DUF465  51.28 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  34.29 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  31.82 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  34.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  30.67 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  29.23 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  33.82 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  27.78 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  30 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>