More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3399 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  100 
 
 		 312 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  90.03 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  90.13 
 
 		 314 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  88.56 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  89.22 
 
 		 311 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  88.89 
 
 		 312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  88.89 
 
 		 312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  88.56 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  89.14 
 
 		 310 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  88.82 
 
 		 310 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  88.82 
 
 		 310 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  85.21 
 
 		 312 aa  564  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  83.87 
 
 		 311 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  84.19 
 
 		 310 aa  551  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  83.23 
 
 		 311 aa  549  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  83.39 
 
 		 310 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  54.84 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  53.96 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  53.64 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.55 
 
 		 305 aa  293  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  50.74 
 
 		 303 aa  291  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  45.94 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  45.94 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.74 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  52.49 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  46.05 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  52.11 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.64 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.34 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  45.8 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.64 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  46.64 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.58 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.64 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.64 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.64 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.64 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.64 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.04 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  47.04 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  48.92 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  46.96 
 
 		 303 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  47.39 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  47.78 
 
 		 310 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  44.76 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  44.76 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.05 
 
 		 303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  44.76 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.48 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.04 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  49.82 
 
 		 317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  46.95 
 
 		 309 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  44.37 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  47.18 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  45.7 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  46.53 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  48.13 
 
 		 306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  45.02 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.84 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.57 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  47.39 
 
 		 305 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  43 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.75 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.4 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  43.4 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.4 
 
 		 311 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.4 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  43.75 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  43.75 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  43.75 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  43.75 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.94 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  46.13 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  46.4 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.13 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  49.08 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  44.2 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  44.2 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.37 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  42.59 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  43.82 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  43.07 
 
 		 311 aa  238  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  44.11 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  42.03 
 
 		 427 aa  216  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  48.12 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  43.9 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  44.73 
 
 		 394 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  36.13 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  36 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  43.88 
 
 		 398 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33 
 
 		 325 aa  198  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  44.16 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  47.71 
 
 		 439 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  36.96 
 
 		 312 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  46.33 
 
 		 416 aa  192  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  46.26 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  45.78 
 
 		 336 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  40.76 
 
 		 369 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  40.91 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  35.51 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>