120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3395 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3395  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
305 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.981621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2064  alpha/beta fold family hydrolase  46.92 
 
 
283 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0471  putative esterase  48.84 
 
 
339 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3925  putative esterase  45.42 
 
 
477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4495  putative esterase  48.06 
 
 
294 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0973  putative esterase  47.93 
 
 
296 aa  241  9e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2744  putative esterase  48.85 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000586392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3719  putative esterase  38.11 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0079  putative esterase  34.27 
 
 
324 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  35.2 
 
 
335 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  28.81 
 
 
298 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2182  putative esterase  32.08 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000263766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1265  putative esterase  32.1 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  31 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  27.1 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  34.73 
 
 
273 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  28.95 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  32.6 
 
 
420 aa  92.4  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3833  IroE protein  29.18 
 
 
272 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3491  esterase  30.94 
 
 
275 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.254505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  27.46 
 
 
422 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3783  hypothetical protein  27.8 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1466  IroE protein  28.4 
 
 
272 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000298906 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3745  hypothetical protein  30.94 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000059605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.67 
 
 
374 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3767  hypothetical protein  30.81 
 
 
272 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  31.1 
 
 
276 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3479  esterase  30.04 
 
 
275 aa  85.9  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  27.75 
 
 
288 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3579  hypothetical protein  30.49 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3863  hypothetical protein  30.49 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2405  putative esterase  27.97 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000464858  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1979  IroE protein  26.21 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6337  putative esterase  28.91 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  35.19 
 
 
423 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3083  putative esterase  33 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1694  putative esterase  27.92 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3502  putative esterase  27.06 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0583  putative esterase  30.64 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  27.03 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1192  putative esterase  27.56 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00663281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0242  putative esterase  30.23 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1658  putative esterase  28.34 
 
 
430 aa  77  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125907  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  25.68 
 
 
462 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36990  esterase  28.41 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0582234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  30.86 
 
 
460 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29340  hypothetical protein  27.7 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3796  putative esterase  29.17 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  28.98 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  29.31 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3965  hypothetical protein  28.5 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.956387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  22.05 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21170  esterase  23.37 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1097  putative esterase  26.92 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2538  putative esterase  28.76 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  27.6 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0676  putative esterase  45.07 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3612  putative esterase  27.91 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0681  putative esterase  28.28 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  26.74 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0577  putative esterase  28.18 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5552  putative esterase  24.05 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.927665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  26.71 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2339  putative esterase  24.2 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4185  hypothetical protein  32.82 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2370  putative esterase  26.37 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5261  putative esterase  27.88 
 
 
370 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  25.64 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3025  hypothetical protein  27.18 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1939  putative esterase  29.81 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.240589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  25.75 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6478  esterase  23.59 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4810  putative esterase  28.48 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  25 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0532  putative esterase  27.65 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  24.36 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0566  putative esterase  27.38 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.798413  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2707  putative esterase  23.03 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.427697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  31.97 
 
 
448 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4575  putative esterase  22.93 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.971846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  30 
 
 
404 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  23.7 
 
 
384 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3791  putative esterase  23.17 
 
 
262 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  26.34 
 
 
412 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  25.57 
 
 
400 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0297  hydrolase  25.13 
 
 
272 aa  59.3  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00178815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  25.32 
 
 
280 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07801  putative siderophore-degrading esterase (Eurofung)  33.33 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  25.15 
 
 
384 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1341  putative esterase  28.21 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  25.15 
 
 
384 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  21.49 
 
 
399 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  21.49 
 
 
399 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1067  putative esterase  28.4 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.256453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1038  putative esterase  28.4 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  23.5 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6228  putative esterase  30.43 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.226912  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4207  putative esterase  22.84 
 
 
345 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419848  normal  0.920837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0439  putative esterase  24.69 
 
 
262 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0882  putative esterase  34.07 
 
 
323 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>