211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3353 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  75.5 
 
 		 459 aa  700    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  69.36 
 
 		 476 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  69.36 
 
 		 476 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  100 
 
 		 474 aa  962    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  71.75 
 
 		 474 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  70.33 
 
 		 520 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  68.22 
 
 		 480 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  67.93 
 
 		 480 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  68.35 
 
 		 480 aa  639    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  71.36 
 
 		 480 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  70.38 
 
 		 474 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  71.65 
 
 		 481 aa  626  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  50 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  48.94 
 
 		 434 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  48.94 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  48.41 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  46.34 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  49.4 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  50.48 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  46.12 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  46.33 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 446 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 446 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 464 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  42.09 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 412 aa  179  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  31.47 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  29.64 
 
 		 418 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  29.64 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  34.23 
 
 		 411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  30.03 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  29.52 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  32.17 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  30.54 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 427 aa  157  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  29.14 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  27.66 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  27.66 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  32.65 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  29.75 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 408 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  29.09 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  26.97 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 471 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  27.56 
 
 		 410 aa  140  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  27.82 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 432 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  27.32 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  27.32 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  29.94 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 430 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  27.05 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  27.05 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 421 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  28.8 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  27.04 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  27.04 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  27.04 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  27.04 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  27.04 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  27.04 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  27.04 
 
 		 382 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  27.72 
 
 		 382 aa  130  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  26.78 
 
 		 382 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  26.89 
 
 		 404 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  23.52 
 
 		 726 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  29.06 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 418 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>