66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3347 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  73.56 
 
 
732 aa  1145    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  46.41 
 
 
718 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  46.66 
 
 
738 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  69.77 
 
 
729 aa  1074    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  46.2 
 
 
718 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  72.88 
 
 
732 aa  1140    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  47.15 
 
 
718 aa  668    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  73.36 
 
 
734 aa  1130    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  74.11 
 
 
732 aa  1154    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  46.2 
 
 
718 aa  665    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  46.33 
 
 
718 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  46.47 
 
 
718 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  72.22 
 
 
740 aa  1106    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  45.24 
 
 
718 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  44.84 
 
 
718 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  70.89 
 
 
743 aa  1096    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  73.01 
 
 
732 aa  1138    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  46.6 
 
 
718 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  46.34 
 
 
718 aa  663    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  70.73 
 
 
739 aa  1101    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  100 
 
 
941 aa  1936    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  46 
 
 
718 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  75.34 
 
 
732 aa  1169    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  73.01 
 
 
732 aa  1139    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  73.7 
 
 
731 aa  1152    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  44.97 
 
 
718 aa  641    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  45.54 
 
 
721 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  75.48 
 
 
732 aa  1170    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  46.48 
 
 
718 aa  674    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  75.75 
 
 
732 aa  1174    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  75.89 
 
 
732 aa  1176    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  46.48 
 
 
718 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  46.52 
 
 
718 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  43.86 
 
 
731 aa  616  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  43.82 
 
 
720 aa  569  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  41.9 
 
 
716 aa  566  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  42.52 
 
 
707 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  41.49 
 
 
716 aa  561  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  39.86 
 
 
715 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  36.27 
 
 
767 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  37.14 
 
 
732 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  34.89 
 
 
786 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  31.6 
 
 
725 aa  354  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  31.5 
 
 
704 aa  323  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  30.91 
 
 
714 aa  299  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  29.84 
 
 
714 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  30.24 
 
 
721 aa  295  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  29 
 
 
722 aa  281  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  29.64 
 
 
712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  27.43 
 
 
720 aa  261  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  28.61 
 
 
706 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  28.16 
 
 
701 aa  218  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  28.45 
 
 
706 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  28.32 
 
 
706 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  27.76 
 
 
713 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  27.98 
 
 
714 aa  200  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  28.51 
 
 
688 aa  196  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  34.2 
 
 
718 aa  194  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  27.41 
 
 
751 aa  194  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  25.79 
 
 
710 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  27.56 
 
 
711 aa  181  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  26.06 
 
 
759 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  25.71 
 
 
602 aa  52.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  35.23 
 
 
1394 aa  51.6  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  27.98 
 
 
630 aa  47  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  34.21 
 
 
840 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>