More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3301 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3167  putative peptidase  46.85 
 
 
819 aa  780    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0614  dipeptidyl peptidase IV, putative  71.17 
 
 
826 aa  1276    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  69.84 
 
 
827 aa  1270    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000293911  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0576  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.77 
 
 
828 aa  1289    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.115519  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  73.7 
 
 
828 aa  1301    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02195  Dipeptidyl peptidase IV  47.79 
 
 
831 aa  792    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  73.49 
 
 
831 aa  1310    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.29 
 
 
827 aa  1279    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2525  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  48.59 
 
 
850 aa  830    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0608  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  72.38 
 
 
826 aa  1292    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3422  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  72.86 
 
 
826 aa  1299    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.286167 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3700  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  72.56 
 
 
826 aa  1306    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000363184  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
829 aa  1728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  72.74 
 
 
826 aa  1295    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  72.56 
 
 
826 aa  1308    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000738695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3014  dipeptidyl peptidase IV, putative  70.93 
 
 
824 aa  1246    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003026  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3883  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  72.56 
 
 
826 aa  1308    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0168383  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0642  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.17 
 
 
826 aa  1279    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  72.32 
 
 
823 aa  1296    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000257692  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3933  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.04 
 
 
789 aa  630  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03743  dipeptidyl peptidase  41.03 
 
 
786 aa  597  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0013  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.72 
 
 
795 aa  581  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439144  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0015  dipeptidyl-peptidase  39.47 
 
 
795 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2851  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.05 
 
 
811 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.342438  normal  0.410655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1969  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.55 
 
 
787 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0328  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.94 
 
 
800 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.88 
 
 
767 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.96 
 
 
771 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.77 
 
 
771 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  31.34 
 
 
741 aa  187  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.77 
 
 
766 aa  187  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.35 
 
 
750 aa  184  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  29.16 
 
 
775 aa  183  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.68 
 
 
760 aa  183  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.79 
 
 
768 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  31.47 
 
 
763 aa  180  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  31.25 
 
 
763 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  31.25 
 
 
763 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  26.15 
 
 
752 aa  178  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4258  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.53 
 
 
812 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.575828  normal  0.163799 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  31.03 
 
 
763 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.69 
 
 
765 aa  173  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.38 
 
 
748 aa  172  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  27.63 
 
 
735 aa  172  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  27.27 
 
 
768 aa  171  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.75 
 
 
733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.21 
 
 
741 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  27.98 
 
 
729 aa  162  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04800  dipeptidyl aminopeptidase IV  26.83 
 
 
721 aa  160  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.03 
 
 
767 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.95 
 
 
751 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1409  dipeptidyl-peptidase IV  28.29 
 
 
754 aa  157  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.07 
 
 
723 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0996  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.78 
 
 
771 aa  153  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  24.01 
 
 
732 aa  149  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1151  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.38 
 
 
750 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16756  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.44 
 
 
721 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0505  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.23 
 
 
709 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1057  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.47 
 
 
737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0728154  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.67 
 
 
724 aa  142  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4504  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.69 
 
 
739 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1194  Dipeptidyl-peptidase IV  27.34 
 
 
757 aa  136  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.929099 
 
 
-
 
NC_002950  PG0503  dipeptidyl aminopeptidase IV  27.69 
 
 
723 aa  134  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  29.84 
 
 
568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4028  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.64 
 
 
732 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2549  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.99 
 
 
725 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0485  putative peptidase  34.42 
 
 
711 aa  122  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3418  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.13 
 
 
738 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1624  dipeptidyl-peptidase IV  33.68 
 
 
228 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.23 
 
 
652 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.04 
 
 
692 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.38 
 
 
615 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  26.67 
 
 
678 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3912  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.56 
 
 
701 aa  114  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0056  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  23.17 
 
 
747 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23950  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  28.57 
 
 
711 aa  111  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111668  normal  0.0730472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3909  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.71 
 
 
732 aa  110  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2523  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.4 
 
 
740 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603054  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.97 
 
 
688 aa  109  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.17 
 
 
617 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1085  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.43 
 
 
718 aa  109  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.968267  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1335  peptidase S9, dipeptidylpeptidase  24.55 
 
 
749 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180958  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2538  Dipeptidyl-peptidase IV  25.06 
 
 
1006 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2431  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.24 
 
 
735 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474543  normal  0.175702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3655  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.24 
 
 
726 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0640869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5657  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.87 
 
 
693 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.56481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2346  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.32 
 
 
708 aa  105  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.84 
 
 
708 aa  104  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  26.03 
 
 
657 aa  103  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.4 
 
 
691 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8451  peptidase, S9B (dipeptidyl peptidase IV) subfamily  30.7 
 
 
689 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.695642  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  26.57 
 
 
643 aa  100  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.96 
 
 
638 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.35 
 
 
653 aa  100  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.94 
 
 
697 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.02 
 
 
656 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3971  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.24 
 
 
671 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.330522  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2619  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.62 
 
 
735 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0220862  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.41 
 
 
596 aa  99  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.09 
 
 
628 aa  98.6  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>