19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3293 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  49.14 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  49.14 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  49.14 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  49.14 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  47.41 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  47.41 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  47.41 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0651  hypothetical protein  48.28 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000188562  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  46.55 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  43.81 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  40.71 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  43.27 
 
 		 109 aa  90.5  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  44.05 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  45.24 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.35 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  26.87 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  29.69 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  32 
 
 		 105 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>