62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3164 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 		 129 aa  266  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  63.28 
 
 		 132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  62.5 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  62.5 
 
 		 132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  62.5 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  61.72 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  62.6 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  58.27 
 
 		 136 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  61.79 
 
 		 129 aa  157  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  60.16 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  59.35 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  50.42 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  51.18 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  51.59 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  42.97 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  50 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  44.19 
 
 		 136 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.35 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  39.82 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.86 
 
 		 288 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.43 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2894  hypothetical protein  28.91 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000016603  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  38.05 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.29 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.06 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.5 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  36.28 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.3 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.36 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  29.46 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.23 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  32.41 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  34.86 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  27.91 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.48 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  33.08 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  27.74 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0303  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.11 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.47 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0353  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.9 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  33.94 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  28.79 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.66 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  32.11 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  29.77 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.56 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.19 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.15 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  31.58 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.19 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  26.55 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.09 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.96 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  31.53 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  29.46 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1922  hypothetical protein  25.23 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>