31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3117 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  89.27 
 
 		 224 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  68.34 
 
 		 199 aa  307  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  67.5 
 
 		 216 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2764  hypothetical protein  60.3 
 
 		 199 aa  271  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  55.38 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  41.18 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  24.47 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  28.36 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  24.46 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  23.47 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  22.61 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  24.14 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  22.54 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  20.81 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  23.08 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  24.54 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  24.12 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  21.72 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  27.62 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  24.19 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  22.75 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  20.63 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  22.68 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  21.43 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  20.97 
 
 		 206 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  23.42 
 
 		 210 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  21.81 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  23.27 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  19.46 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>