132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3025 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  474  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  71.67 
 
 		 240 aa  367  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  67.08 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  67.5 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  67.08 
 
 		 240 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  67.08 
 
 		 240 aa  334  9e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  67.08 
 
 		 240 aa  333  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  65.83 
 
 		 240 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  65.42 
 
 		 240 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  64.58 
 
 		 240 aa  322  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  61.67 
 
 		 280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  59.02 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  54.32 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  53.09 
 
 		 239 aa  242  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  52.23 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  39.74 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  40.43 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  41.23 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  39.27 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  39.27 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  38.81 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  36.56 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  38.36 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  36.96 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  37.73 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  35.53 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  37.73 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  37.73 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  37.73 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  36.14 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  32.81 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  38.24 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  32.08 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  33.64 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  34.62 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  34.13 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  33.93 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  32.44 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  31.72 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  29.85 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  33.18 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  32.41 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  32.03 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  32.26 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  33.94 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  32.77 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  28.26 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  28.15 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  35.53 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  30.8 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  34.08 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  31.03 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  29.87 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  34 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  32.7 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  30.04 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  28.94 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  34.88 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  30.74 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  28.22 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  27.72 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  30.46 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  28.26 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  31.14 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  31.75 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  38.4 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  33.01 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  31.75 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  29.5 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  35.71 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  31.76 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  30.28 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  28.2 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  31.32 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  29.85 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  30.81 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  28.26 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  25.42 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  29.13 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  37.7 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  30.17 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  26.8 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  24.69 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  26.91 
 
 		 281 aa  72  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  37.96 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  28.82 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  28.11 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  28.22 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  29.26 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  24.77 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  26.16 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  26.03 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3246  hypothetical protein  29.74 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.789189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  39.08 
 
 		 287 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  26.99 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  25.62 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  25.62 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  28.18 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>