More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3002 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.2 
 
 		 706 aa  845    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  66.57 
 
 		 706 aa  951    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.94 
 
 		 705 aa  981    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1103  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.85 
 
 		 706 aa  942    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.540965  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  70.07 
 
 		 705 aa  985    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.27 
 
 		 706 aa  978    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.14 
 
 		 706 aa  963    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.99 
 
 		 706 aa  974    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.1 
 
 		 705 aa  932    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.42 
 
 		 706 aa  967    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.27 
 
 		 706 aa  977    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 705 aa  1425    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.27 
 
 		 706 aa  978    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01109  methyl-accepting chemotaxis protein  39.5 
 
 		 743 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.79 
 
 		 707 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  37.56 
 
 		 704 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  32.91 
 
 		 695 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.15 
 
 		 688 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 688 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 688 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  32.68 
 
 		 712 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  32.32 
 
 		 712 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 688 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.22 
 
 		 716 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  31.5 
 
 		 714 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.39 
 
 		 713 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  30.93 
 
 		 714 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  31.09 
 
 		 738 aa  298  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.37 
 
 		 714 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  32.37 
 
 		 714 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 		 714 aa  294  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.81 
 
 		 714 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  31.64 
 
 		 715 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.41 
 
 		 714 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 712 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1940  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.66 
 
 		 716 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000108039 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  35.47 
 
 		 697 aa  270  8.999999999999999e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  33.52 
 
 		 698 aa  257  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003063  methyl-accepting chemotaxis protein  34.31 
 
 		 682 aa  251  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  29.48 
 
 		 701 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 		 636 aa  231  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  29.57 
 
 		 720 aa  227  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.51 
 
 		 730 aa  227  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.64 
 
 		 741 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.06 
 
 		 699 aa  225  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 645 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  27.73 
 
 		 706 aa  224  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.12 
 
 		 632 aa  223  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.51 
 
 		 629 aa  223  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 		 630 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  26.99 
 
 		 713 aa  221  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 645 aa  221  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  31.91 
 
 		 623 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  32.19 
 
 		 623 aa  218  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.26 
 
 		 645 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 		 533 aa  216  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 627 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 637 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.65 
 
 		 730 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45 
 
 		 533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 645 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  30.65 
 
 		 622 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.45 
 
 		 731 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 548 aa  213  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 541 aa  213  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 		 623 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 		 626 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  41.79 
 
 		 533 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 		 645 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 		 533 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  41.04 
 
 		 569 aa  210  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.12 
 
 		 637 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  32.1 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  30.11 
 
 		 652 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 		 638 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.82 
 
 		 631 aa  208  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  40.51 
 
 		 628 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 		 636 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 		 554 aa  207  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 		 643 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.95 
 
 		 630 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  29.38 
 
 		 629 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.9 
 
 		 630 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  31.03 
 
 		 627 aa  206  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.76 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.32 
 
 		 554 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  35.94 
 
 		 545 aa  204  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  29.29 
 
 		 629 aa  204  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.72 
 
 		 554 aa  204  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  29.14 
 
 		 630 aa  203  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 		 648 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.76 
 
 		 630 aa  204  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.32 
 
 		 538 aa  203  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 554 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.26 
 
 		 564 aa  203  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 		 543 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  39.33 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 543 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 		 543 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>