77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2845 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  62.84 
 
 		 186 aa  278  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  63.39 
 
 		 189 aa  276  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  62.16 
 
 		 185 aa  270  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  67.39 
 
 		 186 aa  267  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  66.12 
 
 		 185 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  67.93 
 
 		 186 aa  258  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  67.93 
 
 		 186 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  67.93 
 
 		 186 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  67.93 
 
 		 186 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  67.93 
 
 		 186 aa  257  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  68.85 
 
 		 186 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  66.67 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  66.67 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  66.12 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  63.39 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  37.14 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  33.15 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  33.16 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  36.42 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  32.98 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  28.88 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  29.94 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  32.22 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  35.43 
 
 		 187 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  32.12 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  34.3 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  26.37 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  34.29 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  32.54 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  27.17 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  33.72 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  26.78 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  33.14 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  27.81 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  29.84 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  27.62 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  28.18 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  28.09 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  23.2 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  28.49 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  23.49 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  27.62 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  26.67 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  27.42 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  27.42 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  27.04 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  23.37 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  22.35 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  25.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  24.73 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  25.13 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  28.82 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  27.93 
 
 		 178 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  27.37 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  27.22 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2113  hypothetical protein  30.65 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  25.67 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  28.25 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  27.43 
 
 		 192 aa  47.8  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  25.7 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  23.96 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  22.73 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2105  hypothetical protein  32.71 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0959  hypothetical protein  30.65 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4738  hypothetical protein  23.3 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  25.48 
 
 		 212 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  24.57 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  24.28 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  25.14 
 
 		 211 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  25.41 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>