More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2791 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  87.06 
 
 		 201 aa  359  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  71.29 
 
 		 209 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  71.29 
 
 		 209 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  73.4 
 
 		 203 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  71.84 
 
 		 206 aa  298  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  71.36 
 
 		 206 aa  298  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  71.36 
 
 		 206 aa  297  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  71.36 
 
 		 206 aa  297  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  71.36 
 
 		 206 aa  297  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  71.36 
 
 		 206 aa  297  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  72.41 
 
 		 203 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  70.87 
 
 		 206 aa  294  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  73.66 
 
 		 205 aa  289  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  69.5 
 
 		 200 aa  278  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  70.65 
 
 		 200 aa  260  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  54.64 
 
 		 194 aa  201  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  57.93 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  59.77 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  49.74 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  54.65 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  47.98 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  53.55 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  54.09 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  54.49 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  53.46 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  52.44 
 
 		 195 aa  167  8e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  54.17 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  56.05 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  52.2 
 
 		 184 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  54.78 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  55.41 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  48.78 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  48.28 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  56.08 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  48.17 
 
 		 187 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  55.13 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  49.36 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  53.19 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  47.15 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  47.15 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  45.69 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  47.15 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  50 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  48.99 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  53.85 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  46.63 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  48.37 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  51.35 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  48.39 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  43.79 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  44.91 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  45.64 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  40.51 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  48.61 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  47.24 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  49.68 
 
 		 184 aa  138  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  44.52 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  47.37 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  41.42 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  46.15 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  46.15 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  48.12 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  46.15 
 
 		 196 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  44 
 
 		 199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  46.15 
 
 		 196 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  46.15 
 
 		 196 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  37.68 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  48.61 
 
 		 184 aa  134  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  47.95 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  46.81 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2372  GrpE protein  40.8 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.919254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  48.57 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  48.57 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  44.15 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  41.57 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  47.74 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  47.74 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  47.14 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  41.57 
 
 		 230 aa  131  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  38.1 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  47.14 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  47.14 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  47.14 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  50 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  48.57 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  43.51 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  42.46 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  42.46 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  42.46 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  42.46 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  42.46 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  42.46 
 
 		 196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  43.45 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  42.46 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  42.7 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  47.48 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.9 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  47.14 
 
 		 178 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  41.15 
 
 		 184 aa  128  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>