More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2766 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  100 
 
 		 323 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  87.31 
 
 		 323 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  87.93 
 
 		 323 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  87.62 
 
 		 323 aa  598  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  86.07 
 
 		 323 aa  594  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  86.69 
 
 		 323 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  86.69 
 
 		 323 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  86.69 
 
 		 323 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  86.69 
 
 		 323 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  86.69 
 
 		 323 aa  591  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  85.45 
 
 		 323 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  85.14 
 
 		 323 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  85.45 
 
 		 323 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  86.07 
 
 		 323 aa  584  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  84.83 
 
 		 323 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  84.52 
 
 		 323 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  70.9 
 
 		 323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  71.21 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  72.82 
 
 		 319 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  70.19 
 
 		 322 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  69.35 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  69.35 
 
 		 332 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  69.66 
 
 		 332 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  69.44 
 
 		 333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  69.35 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  69.47 
 
 		 322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  64.81 
 
 		 332 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  64.51 
 
 		 332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  70.19 
 
 		 322 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  63.5 
 
 		 332 aa  435  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  70.25 
 
 		 322 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  61.49 
 
 		 321 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  57.63 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  58.62 
 
 		 319 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  59.46 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  61 
 
 		 324 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  57.1 
 
 		 323 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  58.13 
 
 		 321 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  62.08 
 
 		 329 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  58.99 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  56.11 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  54.23 
 
 		 312 aa  342  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  55.22 
 
 		 354 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  55.22 
 
 		 354 aa  341  8e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  55.22 
 
 		 348 aa  341  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  53.87 
 
 		 312 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  59.86 
 
 		 333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  52.81 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  52.1 
 
 		 316 aa  328  8e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  56.84 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  55.79 
 
 		 324 aa  322  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  54.14 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  48.55 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  34.87 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  34.47 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  34.35 
 
 		 274 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  33.59 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  33.96 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  34.07 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  34.1 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  34.96 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.69 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  31.42 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  31.42 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  31.42 
 
 		 272 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  33.71 
 
 		 268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  32.96 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  31.2 
 
 		 273 aa  123  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  29.9 
 
 		 285 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  31.82 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  31.72 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  31.62 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  32.22 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  31.09 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  25.97 
 
 		 269 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  32.18 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  32.06 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  31.58 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  29.78 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  31.54 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  30.82 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  28.81 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  30.63 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  25.72 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  31.82 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.41 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.04 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3266  phosphate-binding protein  27.47 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  28.88 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  30 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  30.07 
 
 		 278 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  30.77 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.61 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  28.2 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  30.56 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.37 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  28.93 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  31.37 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>