40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2757 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2757  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  297  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  34.29 
 
 		 170 aa  93.2  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  35 
 
 		 168 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  34.29 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  39.45 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  40.19 
 
 		 202 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  31.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  31.16 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  37.14 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  31.16 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  31.16 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3986  copper resistance lipoprotein NlpE  37.04 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.773846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  34.55 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1548  lipoprotein  29.91 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000337346  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.78 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  32.43 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3071  lipoprotein  31.5 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  28.18 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3215  lipoprotein, putative  26.47 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2819  lipoprotein  26.47 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  30.36 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03210  lipoprotein  27.27 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1626  hypothetical protein  23.18 
 
 		 402 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00390674  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0033  hypothetical protein  30.48 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0041  hypothetical protein  31.13 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  26.73 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  26.73 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  26.73 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1474  hypothetical protein  26.42 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0773406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2012  hypothetical protein  23.61 
 
 		 254 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1524  hypothetical protein  24 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  21.24 
 
 		 236 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  21.24 
 
 		 236 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.451187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  21.24 
 
 		 236 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  21.24 
 
 		 236 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  21.24 
 
 		 236 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  21.24 
 
 		 236 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  21.24 
 
 		 236 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  28.79 
 
 		 192 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>