More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2659 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.74 
 
 		 635 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  56.74 
 
 		 635 aa  696    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  59.31 
 
 		 639 aa  733    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  55.02 
 
 		 636 aa  694    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  55.23 
 
 		 649 aa  693    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  55.64 
 
 		 634 aa  704    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  51.39 
 
 		 645 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  83.49 
 
 		 641 aa  1084    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  55.04 
 
 		 637 aa  682    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  82.97 
 
 		 640 aa  1087    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  51.63 
 
 		 640 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  76.56 
 
 		 638 aa  983    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  56.74 
 
 		 635 aa  696    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  57.79 
 
 		 635 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  57.52 
 
 		 638 aa  704    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  57.79 
 
 		 635 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  82.94 
 
 		 638 aa  1051    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  56.9 
 
 		 637 aa  742    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  83.8 
 
 		 641 aa  1085    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  57.05 
 
 		 637 aa  741    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  56.74 
 
 		 635 aa  696    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  53.07 
 
 		 646 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  54.49 
 
 		 642 aa  686    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  56.74 
 
 		 635 aa  696    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  81.31 
 
 		 639 aa  1042    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  57.79 
 
 		 635 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  56.74 
 
 		 635 aa  697    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  59.88 
 
 		 636 aa  723    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  56.7 
 
 		 635 aa  700    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  57.79 
 
 		 635 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  58.69 
 
 		 639 aa  743    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  85.25 
 
 		 640 aa  1077    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000565711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  56.9 
 
 		 635 aa  710    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  56.58 
 
 		 635 aa  696    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  83.33 
 
 		 641 aa  1083    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  83.33 
 
 		 641 aa  1083    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  80.16 
 
 		 645 aa  1033    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  53.65 
 
 		 647 aa  694    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  56.9 
 
 		 637 aa  742    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  56.43 
 
 		 635 aa  717    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0797  ABC transporter ATPase component  56.48 
 
 		 644 aa  667    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131165  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  57.79 
 
 		 635 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  82.97 
 
 		 640 aa  1087    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  82.97 
 
 		 640 aa  1083    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  100 
 
 		 638 aa  1305    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  83.33 
 
 		 641 aa  1083    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  80.91 
 
 		 639 aa  1003    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  83.12 
 
 		 640 aa  1086    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  58.84 
 
 		 639 aa  744    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  50 
 
 		 643 aa  616  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  51.57 
 
 		 631 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  49.38 
 
 		 642 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 		 632 aa  601  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  50.08 
 
 		 650 aa  592  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  50.15 
 
 		 642 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  49.61 
 
 		 623 aa  595  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  46.71 
 
 		 648 aa  591  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  47.17 
 
 		 632 aa  589  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  50.46 
 
 		 642 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  46.81 
 
 		 653 aa  587  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  50.31 
 
 		 642 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  50.46 
 
 		 642 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  48.61 
 
 		 645 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  46.4 
 
 		 648 aa  584  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  51.47 
 
 		 641 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  50.31 
 
 		 637 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  51.7 
 
 		 639 aa  581  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  48.12 
 
 		 635 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  49.53 
 
 		 648 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2140  ABC transporter ATP-binding protein  51.47 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  47.08 
 
 		 649 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  46.92 
 
 		 649 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25020  ABC transporter ATP-binding protein  51.32 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  46.49 
 
 		 642 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  50.62 
 
 		 640 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  46.92 
 
 		 649 aa  572  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  46.91 
 
 		 641 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  48.51 
 
 		 627 aa  565  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  47.34 
 
 		 617 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  46.78 
 
 		 641 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  47.01 
 
 		 649 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  47.01 
 
 		 661 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  48.25 
 
 		 615 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  47.01 
 
 		 661 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 		 636 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  49.69 
 
 		 636 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  46.51 
 
 		 641 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1987  hypothetical protein  46.55 
 
 		 617 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 633 aa  552  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 648 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 660 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 648 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 648 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  45.67 
 
 		 640 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 648 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  45.68 
 
 		 663 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 660 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 1065 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  45.68 
 
 		 636 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 660 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>