299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2631 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  68.36 
 
 		 256 aa  358  6e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  67.97 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  65.62 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  65.62 
 
 		 257 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  65.62 
 
 		 257 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1628  hypothetical protein  65.62 
 
 		 257 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  65.23 
 
 		 257 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  65.23 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  66.41 
 
 		 257 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  64.84 
 
 		 257 aa  340  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  63.67 
 
 		 257 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  62.11 
 
 		 257 aa  322  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  64.84 
 
 		 256 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  59.53 
 
 		 257 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  53.12 
 
 		 257 aa  271  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  49.8 
 
 		 259 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  52.38 
 
 		 256 aa  255  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  50.4 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  50.2 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  48.45 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  49.81 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  49.42 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  49.42 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  49.42 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  50.2 
 
 		 261 aa  241  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  50.58 
 
 		 259 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  49.42 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  47.47 
 
 		 280 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  47.08 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18220  hypothetical protein  45.1 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891224  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  38.06 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  36.68 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  36.05 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  38.78 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  37.25 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  38.37 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  39.15 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  42.15 
 
 		 251 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  39.3 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  40.59 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  36.96 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  37.35 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  37.35 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  36.96 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  34.66 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  37.35 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  37.35 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  36.99 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  36.92 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  36.72 
 
 		 269 aa  148  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  36.72 
 
 		 269 aa  148  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  36.96 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  33.72 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  38.21 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  35.71 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  37.14 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  37.25 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  37.45 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  36.33 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  34.39 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  36.9 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  34.39 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  33.99 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  34.8 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  37.25 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  38.68 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  36.25 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  35.57 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  38.68 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  36.65 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  36.65 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  36.65 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  38.59 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  38.59 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  36.14 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  37.34 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  37.76 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  32.13 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  36.17 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  34.12 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  36.08 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  37.34 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  37.2 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  38.17 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  37.76 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  41.67 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  37.07 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  41.67 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  36.72 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  34.14 
 
 		 266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  34.48 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  34.62 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  35.15 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>