170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2591 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  46.43 
 
 		 196 aa  187  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  45.71 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  41.88 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  42.63 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  43.78 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  43.78 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  43.78 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  43.24 
 
 		 220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  42.41 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  38.86 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  35.88 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  29.26 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  30.98 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  32.14 
 
 		 193 aa  94.7  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  30.32 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  34.13 
 
 		 187 aa  92  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  32.34 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  29.83 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  32.43 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 		 187 aa  85.1  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  28.72 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  26.18 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  26.49 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  27.63 
 
 		 949 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.39 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  26.42 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  24.65 
 
 		 412 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  27.53 
 
 		 343 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  24.6 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  23.11 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  24.54 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4621  pentapeptide repeat-containing protein  27.74 
 
 		 430 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  25.84 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  23.62 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  21.83 
 
 		 356 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  19.21 
 
 		 319 aa  51.6  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  22.84 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  23.22 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  24.6 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  25.69 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  20.4 
 
 		 449 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  21.66 
 
 		 355 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  33.66 
 
 		 368 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  27.07 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  22.37 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  26.4 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3961  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 		 333 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0697467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  23.86 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  26.59 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  25.15 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  18.4 
 
 		 312 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  20.38 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  22.8 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  21.6 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  20.73 
 
 		 734 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  24.74 
 
 		 846 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  23.37 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  21.6 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5571  hypothetical protein  23.95 
 
 		 430 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.422571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  27.38 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  23.53 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  24.85 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  21.6 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  19.11 
 
 		 320 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  24.29 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3926  pentapeptide repeat protein  24.38 
 
 		 430 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 862 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  22.96 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 		 825 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  25.28 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  23.26 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  20.59 
 
 		 881 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  23.27 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  23.4 
 
 		 340 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  23.86 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  20.1 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  18.32 
 
 		 381 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  21.59 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  22.22 
 
 		 309 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>