53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2522 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 
326 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  46.18 
 
 
326 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  43.12 
 
 
326 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00308  peptidase M56, BlaR1  32.4 
 
 
314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  29.49 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  32.09 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  29.23 
 
 
324 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  30.07 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  27.63 
 
 
270 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3768  hypothetical protein  29.17 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  27.32 
 
 
270 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  27.32 
 
 
270 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  26.78 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  24.73 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  24.73 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  25.5 
 
 
270 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  25.66 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  25.66 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  25.66 
 
 
270 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  25.66 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  25.83 
 
 
270 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4390  peptidase M56 BlaR1  25.83 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431329  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  25.6 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  30.88 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  29.93 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  27.54 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  24.72 
 
 
314 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  26.13 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  47.37 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  22.47 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  37.33 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  43.86 
 
 
290 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  41.38 
 
 
292 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  28.37 
 
 
334 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  24.86 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  29.37 
 
 
465 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  23.5 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  26.92 
 
 
282 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  40.35 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  36.92 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  40.35 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  42.11 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  43.86 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  36.17 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  37.29 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  27.06 
 
 
328 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1976  peptidase M48, Ste24p  33.82 
 
 
295 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  37.93 
 
 
293 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  36.84 
 
 
292 aa  42.7  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  36.21 
 
 
477 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.973642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>