209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2443 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.67 
 
 		 712 aa  1175    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3756  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  77.67 
 
 		 712 aa  1175    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1600  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  80.43 
 
 		 705 aa  1210    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.84 
 
 		 705 aa  1256    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837695  hitchhiker  0.000803625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2183  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.67 
 
 		 616 aa  658    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2086  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.21 
 
 		 723 aa  726    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2834  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.13 
 
 		 705 aa  1247    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4798  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.81 
 
 		 712 aa  1177    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3691  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.66 
 
 		 712 aa  1198    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0417  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.95 
 
 		 712 aa  1166    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4846  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.38 
 
 		 712 aa  1172    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.95 
 
 		 712 aa  1169    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2619  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  79.86 
 
 		 705 aa  1213    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.81 
 
 		 712 aa  1177    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3748  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.66 
 
 		 712 aa  1194    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000107  ribonucleotide reductase of class III (anaerobic) large subunit  76.39 
 
 		 706 aa  1154    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21480  ribonucleoside-triphosphate reductase class III catalytic subunit  50.21 
 
 		 754 aa  718    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3049  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  79.72 
 
 		 705 aa  1194    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0131887  normal  0.0662102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1419  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.13 
 
 		 704 aa  1238    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0525  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.95 
 
 		 712 aa  1189    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04070  hypothetical protein  77.67 
 
 		 712 aa  1175    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4734  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.81 
 
 		 712 aa  1177    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.715295  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1468  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  72.24 
 
 		 708 aa  1095    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.897136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2441  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.27 
 
 		 705 aa  1246    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2511  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.55 
 
 		 705 aa  1249    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2443  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  100 
 
 		 705 aa  1482    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4703  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.81 
 
 		 712 aa  1178    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.8 
 
 		 747 aa  714    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1116  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.11 
 
 		 733 aa  678    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.287436  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0138  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.61 
 
 		 738 aa  676    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.450422 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1539  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.73 
 
 		 736 aa  653    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.854468  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1942  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.93 
 
 		 734 aa  721    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.81 
 
 		 712 aa  1177    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2603  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.27 
 
 		 705 aa  1247    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000597359 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0791  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  73.86 
 
 		 706 aa  1125    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1275  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.87 
 
 		 705 aa  1189    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4035  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.66 
 
 		 712 aa  1198    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0740  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  69.42 
 
 		 704 aa  1067    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5758  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.52 
 
 		 712 aa  1174    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4853  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.81 
 
 		 712 aa  1176    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1687  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.7 
 
 		 705 aa  1253    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.673685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.52 
 
 		 712 aa  1184    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1665  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.84 
 
 		 705 aa  1256    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  81.28 
 
 		 705 aa  1214    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0437  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.95 
 
 		 712 aa  1174    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1540  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.27 
 
 		 705 aa  1249    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0445  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  75.11 
 
 		 706 aa  1138    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2640  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.64 
 
 		 616 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1317  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.66 
 
 		 744 aa  681    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3773  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.67 
 
 		 712 aa  1176    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2694  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.64 
 
 		 616 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4832  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.81 
 
 		 712 aa  1176    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1650  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.84 
 
 		 705 aa  1255    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3556  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.66 
 
 		 712 aa  1198    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05713  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  75.11 
 
 		 706 aa  1144    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4492  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  77.67 
 
 		 712 aa  1175    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1125  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  42.95 
 
 		 805 aa  614  9.999999999999999e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1929  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.31 
 
 		 802 aa  600  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2300  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  43.61 
 
 		 765 aa  598  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1001  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.69 
 
 		 706 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1233  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  35.98 
 
 		 704 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.45 
 
 		 708 aa  452  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1124  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  34.08 
 
 		 740 aa  397  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02440  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.99 
 
 		 740 aa  393  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.187193  normal  0.336585 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04760  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.02 
 
 		 737 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.496041  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.01 
 
 		 670 aa  356  6.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00598152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.83 
 
 		 676 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0127  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  32.01 
 
 		 736 aa  335  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2830  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.49 
 
 		 705 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1054  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.11 
 
 		 746 aa  333  6e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2516  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.49 
 
 		 705 aa  332  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0702  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.49 
 
 		 769 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000299094  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0048  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.83 
 
 		 759 aa  300  5e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2252  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  32.09 
 
 		 618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00612019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3398  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.27 
 
 		 618 aa  282  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3663  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.27 
 
 		 618 aa  282  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0424871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.27 
 
 		 618 aa  281  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.11 
 
 		 618 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000577057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3614  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.11 
 
 		 618 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.58287e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.94 
 
 		 619 aa  280  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00561072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3310  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.11 
 
 		 618 aa  280  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1604  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.78 
 
 		 618 aa  279  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000379053  hitchhiker  0.000000212198 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3711  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.94 
 
 		 619 aa  279  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0130664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3629  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.94 
 
 		 618 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1260  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.74 
 
 		 798 aa  251  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0351  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.05 
 
 		 789 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.478958  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2571  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  34.77 
 
 		 775 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1071  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  32.72 
 
 		 1197 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00208711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3590  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.26 
 
 		 720 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.66 
 
 		 697 aa  160  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.2 
 
 		 686 aa  156  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.03 
 
 		 695 aa  153  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  23.81 
 
 		 791 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  23.63 
 
 		 791 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.73 
 
 		 689 aa  150  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3016  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.04 
 
 		 685 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.22 
 
 		 683 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.92 
 
 		 704 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4657  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.22 
 
 		 683 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.68774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  23.49 
 
 		 791 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>