169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2373 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1176 aa  733    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1181 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  42.91 
 
 		 1172 aa  999    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  100 
 
 		 1182 aa  2438    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  35.84 
 
 		 1102 aa  683    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  35.37 
 
 		 1171 aa  698    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  31.15 
 
 		 1209 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  31.15 
 
 		 1209 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  31.15 
 
 		 1209 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  31.15 
 
 		 1209 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  31.15 
 
 		 1209 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  31.15 
 
 		 1209 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1205 aa  615  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  31.15 
 
 		 1209 aa  612  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1208 aa  611  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  32.75 
 
 		 1199 aa  608  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  31.42 
 
 		 1209 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  31.8 
 
 		 1211 aa  605  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  31.69 
 
 		 1220 aa  596  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  32.19 
 
 		 1209 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  30.92 
 
 		 1218 aa  565  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  29.64 
 
 		 1212 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  30.39 
 
 		 1175 aa  531  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  30.52 
 
 		 1207 aa  522  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  31.01 
 
 		 1181 aa  516  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  29.07 
 
 		 1164 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  28.48 
 
 		 1302 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  28.29 
 
 		 1302 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  29.42 
 
 		 1302 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  28.18 
 
 		 1302 aa  506  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  29.94 
 
 		 1176 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  27.62 
 
 		 1302 aa  479  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  31.32 
 
 		 1204 aa  473  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1173 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  28.69 
 
 		 1173 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  29.36 
 
 		 1179 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  27.83 
 
 		 1302 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  29.36 
 
 		 1148 aa  452  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  29 
 
 		 1179 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  28.04 
 
 		 1157 aa  449  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1192 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1168 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1175 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1175 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  33.01 
 
 		 1152 aa  416  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  28.79 
 
 		 1289 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  28.55 
 
 		 1289 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  28.63 
 
 		 1289 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  28.63 
 
 		 1289 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  26.66 
 
 		 1329 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  27.01 
 
 		 1268 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1195 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  25.35 
 
 		 1348 aa  356  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  25.38 
 
 		 1187 aa  340  8e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1332 aa  340  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  26.89 
 
 		 1182 aa  338  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  25.14 
 
 		 1317 aa  338  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  25.06 
 
 		 1165 aa  323  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  26.13 
 
 		 1230 aa  320  7.999999999999999e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  26.86 
 
 		 1365 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  24.81 
 
 		 1165 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  24.25 
 
 		 1165 aa  315  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  26.57 
 
 		 1365 aa  313  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  25.46 
 
 		 1275 aa  311  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1275 aa  311  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1369 aa  311  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  24.5 
 
 		 1288 aa  308  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1270 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  24.59 
 
 		 1177 aa  303  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  24.59 
 
 		 1177 aa  303  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 1194 aa  301  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1008 aa  300  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  26.92 
 
 		 1366 aa  297  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1208 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  25.22 
 
 		 1301 aa  289  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  26.07 
 
 		 1358 aa  287  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  26.07 
 
 		 1358 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1297 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  25.7 
 
 		 1358 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1297 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1297 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1297 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1297 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1297 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1297 aa  284  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  26.15 
 
 		 1150 aa  281  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  25.02 
 
 		 1206 aa  278  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1206 aa  278  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  24.51 
 
 		 1205 aa  269  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.36 
 
 		 1194 aa  268  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1315 aa  259  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1164 aa  257  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  22.72 
 
 		 1164 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  32.18 
 
 		 1313 aa  254  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  32.18 
 
 		 1313 aa  254  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  32.24 
 
 		 1314 aa  252  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  32.24 
 
 		 1314 aa  252  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  32.24 
 
 		 1314 aa  252  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  31.83 
 
 		 1315 aa  250  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1313 aa  243  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>