41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2366 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  39.77 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  32.43 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3074  virulence protein, SciE type  26.74 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6048  hypothetical protein  25.87 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  30.04 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  28.1 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  27.39 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3028  virulence protein, SciE type  24.31 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0281455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  25.68 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  27.27 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  25.29 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  24.22 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  27.06 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  24.9 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  25.29 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  28.39 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  28.39 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  29.86 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  25.84 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  27.53 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  27.04 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  28.51 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  25.09 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  25.65 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  27.23 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  23.46 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  22.93 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  24.7 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  24.81 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  24.81 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  24.81 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  24.48 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  24.07 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  24.07 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  24.07 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  24.07 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  23.65 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  23.65 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  20.94 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  19.91 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>