176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2364 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1270    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  39.41 
 
 
607 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  35.6 
 
 
611 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  33.55 
 
 
605 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  35.71 
 
 
610 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  35.07 
 
 
606 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  35.85 
 
 
606 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  34.91 
 
 
606 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  34.8 
 
 
606 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  34.64 
 
 
593 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  32.8 
 
 
611 aa  346  8e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.76 
 
 
590 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.35 
 
 
590 aa  342  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  32.35 
 
 
592 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  32.65 
 
 
619 aa  319  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  33.55 
 
 
616 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  31.48 
 
 
589 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.28 
 
 
612 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  31.65 
 
 
619 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  30.11 
 
 
625 aa  310  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30 
 
 
623 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  31.33 
 
 
619 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  30.44 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  31.4 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  30.44 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  30.44 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  30.44 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  30.44 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  30.28 
 
 
623 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  32.01 
 
 
611 aa  303  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  30.39 
 
 
623 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  33.33 
 
 
611 aa  300  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  33.17 
 
 
611 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  33.17 
 
 
611 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  33.17 
 
 
611 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  33.17 
 
 
611 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  33.17 
 
 
611 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  32.83 
 
 
611 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  30.63 
 
 
624 aa  294  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  30.72 
 
 
628 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.28 
 
 
624 aa  293  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  32.5 
 
 
612 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  32.5 
 
 
612 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  30.55 
 
 
620 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  32.5 
 
 
612 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  32.5 
 
 
612 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  30.28 
 
 
623 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  32.5 
 
 
612 aa  290  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  32.33 
 
 
612 aa  287  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  31.21 
 
 
586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  31.81 
 
 
624 aa  283  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  31.93 
 
 
597 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  31.99 
 
 
597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  30.03 
 
 
610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  31.99 
 
 
597 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  31.6 
 
 
589 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  29.39 
 
 
629 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  28.79 
 
 
638 aa  261  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1175  putative type VI secretion protein VasA-1  26.92 
 
 
593 aa  259  9e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.77 
 
 
630 aa  253  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  31.56 
 
 
616 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  31.56 
 
 
616 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  31.56 
 
 
616 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  31.4 
 
 
616 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  30.96 
 
 
633 aa  251  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  31.09 
 
 
633 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  27.74 
 
 
626 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  27.74 
 
 
626 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  27.74 
 
 
626 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  28.23 
 
 
626 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  29.24 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  30.45 
 
 
660 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.48 
 
 
626 aa  244  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  27.7 
 
 
626 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.12 
 
 
588 aa  242  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  28.93 
 
 
629 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  27.32 
 
 
626 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  27.54 
 
 
626 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  27.54 
 
 
626 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  28.14 
 
 
630 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.85 
 
 
588 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  27.29 
 
 
626 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.53 
 
 
588 aa  236  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  29.46 
 
 
627 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  29.46 
 
 
627 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  29.46 
 
 
627 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.9 
 
 
647 aa  230  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.63 
 
 
629 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  28.03 
 
 
582 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.95 
 
 
652 aa  228  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  27.75 
 
 
590 aa  228  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  28.03 
 
 
620 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  27.54 
 
 
582 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  27.5 
 
 
654 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  27.78 
 
 
589 aa  223  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  27.94 
 
 
629 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  27.94 
 
 
629 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  27.94 
 
 
629 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  27.94 
 
 
629 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  27.94 
 
 
629 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>