More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2360 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 618 aa  1291    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  42.54 
 
 		 611 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  36.87 
 
 		 683 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  37.18 
 
 		 683 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  34.43 
 
 		 643 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  34.43 
 
 		 646 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  35.1 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 		 661 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 		 661 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  34.34 
 
 		 619 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 		 661 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 		 661 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 		 661 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  33.93 
 
 		 741 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  33.59 
 
 		 661 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 		 661 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 		 661 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  36.94 
 
 		 709 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 741 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  33.44 
 
 		 741 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  33.81 
 
 		 689 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  33.81 
 
 		 689 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  34.22 
 
 		 702 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  35.03 
 
 		 703 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  32.89 
 
 		 618 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  34.97 
 
 		 778 aa  350  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  33.12 
 
 		 774 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  34.05 
 
 		 907 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  33.55 
 
 		 730 aa  348  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  33.5 
 
 		 680 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  35.58 
 
 		 794 aa  347  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  32.9 
 
 		 680 aa  346  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  34.43 
 
 		 724 aa  346  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  34.15 
 
 		 687 aa  345  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  33.06 
 
 		 763 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  32.81 
 
 		 748 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.88 
 
 		 756 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  32.66 
 
 		 788 aa  343  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  31.88 
 
 		 734 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 		 572 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  31.88 
 
 		 734 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  32.96 
 
 		 771 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  31.88 
 
 		 734 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  31.88 
 
 		 734 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  31.88 
 
 		 731 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  32.82 
 
 		 694 aa  342  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  31.88 
 
 		 734 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  33.39 
 
 		 755 aa  342  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  31.88 
 
 		 734 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  33.54 
 
 		 616 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  32.81 
 
 		 684 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  32.66 
 
 		 688 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  31.59 
 
 		 757 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  31.71 
 
 		 731 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  36.84 
 
 		 838 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  33.76 
 
 		 680 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  36.45 
 
 		 841 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 		 614 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  32.17 
 
 		 734 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  33.12 
 
 		 611 aa  336  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  31.71 
 
 		 693 aa  336  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 796 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  36.65 
 
 		 841 aa  335  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  31.99 
 
 		 734 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  36.65 
 
 		 841 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  31.78 
 
 		 729 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  33.6 
 
 		 680 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  31.78 
 
 		 729 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  34.47 
 
 		 792 aa  333  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  33.5 
 
 		 669 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  34.49 
 
 		 780 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  32.74 
 
 		 680 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  31.16 
 
 		 769 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  32.71 
 
 		 808 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 		 785 aa  331  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  32.66 
 
 		 613 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  32.48 
 
 		 678 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  31.67 
 
 		 642 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  30.66 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  31.85 
 
 		 743 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  33.22 
 
 		 741 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 618 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  31.22 
 
 		 741 aa  327  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3392  vgrG protein  31.47 
 
 		 695 aa  327  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.92482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  36.03 
 
 		 697 aa  326  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  31.28 
 
 		 730 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  31.31 
 
 		 692 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  31.66 
 
 		 767 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  32.53 
 
 		 676 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  30.76 
 
 		 645 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  33.18 
 
 		 668 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7557  vgrG protein  30.65 
 
 		 653 aa  323  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1646  vgrG protein  31.15 
 
 		 800 aa  323  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  30.77 
 
 		 794 aa  323  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  31.46 
 
 		 777 aa  323  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  32.18 
 
 		 706 aa  321  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 621 aa  321  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  31.49 
 
 		 767 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  32.63 
 
 		 712 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  34.48 
 
 		 668 aa  320  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>