More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2316 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 
313 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  81.79 
 
 
313 aa  527  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  79.81 
 
 
314 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  79.81 
 
 
314 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  79.23 
 
 
314 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  79.81 
 
 
314 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  79.81 
 
 
314 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  79.55 
 
 
314 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  79.81 
 
 
314 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  79.81 
 
 
314 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  79.23 
 
 
314 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  76.92 
 
 
338 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  75.64 
 
 
317 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  74.04 
 
 
312 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  74.11 
 
 
314 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  69.33 
 
 
313 aa  464  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  71.47 
 
 
314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  68.05 
 
 
313 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  67.52 
 
 
314 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  68.05 
 
 
317 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  65.16 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  57.37 
 
 
311 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  57.47 
 
 
311 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  58.77 
 
 
308 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  57.47 
 
 
311 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  58.44 
 
 
311 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  57.47 
 
 
311 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  57.79 
 
 
310 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  58.01 
 
 
308 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  57.47 
 
 
311 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  53.05 
 
 
310 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  52.73 
 
 
310 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  52.58 
 
 
310 aa  318  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  51.94 
 
 
308 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  51.94 
 
 
308 aa  315  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  52.09 
 
 
309 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  52.09 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  52.09 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  52.33 
 
 
309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  50.32 
 
 
306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  51.77 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  50.48 
 
 
316 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  50.32 
 
 
306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  50.32 
 
 
306 aa  309  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  50 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  50 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  49.68 
 
 
306 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  50.81 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
306 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 
306 aa  298  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  52.72 
 
 
310 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 
307 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 
306 aa  295  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  48.7 
 
 
306 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  49.67 
 
 
306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  46.62 
 
 
308 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  45.22 
 
 
312 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  48.06 
 
 
309 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  45.16 
 
 
313 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  43.87 
 
 
310 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  46.3 
 
 
308 aa  278  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  48.53 
 
 
306 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  46.65 
 
 
308 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  43.75 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  48.4 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  45.69 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  45.69 
 
 
314 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  45.69 
 
 
314 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  44.23 
 
 
309 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  41.21 
 
 
311 aa  256  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  41.92 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  45.75 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  35.87 
 
 
316 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  35.87 
 
 
316 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  35.81 
 
 
313 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  36.88 
 
 
314 aa  198  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  35.67 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  37.27 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  34.85 
 
 
319 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  35.79 
 
 
308 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  34.15 
 
 
320 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  36.22 
 
 
322 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  36.84 
 
 
298 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  35.97 
 
 
316 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  34.75 
 
 
299 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  35.79 
 
 
300 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  35.19 
 
 
299 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  33.23 
 
 
311 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  37.28 
 
 
299 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  35.44 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  34.74 
 
 
299 aa  188  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  34.91 
 
 
321 aa  188  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  35.46 
 
 
298 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  35.46 
 
 
298 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  35.46 
 
 
298 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  34.91 
 
 
321 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>