15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2192 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2192  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  781    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000550171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2374  hypothetical protein  62.78 
 
 		 364 aa  482  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2087  hypothetical protein  63.8 
 
 		 383 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.658279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2583  hypothetical protein  62.09 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.571269  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2022  hypothetical protein  61.56 
 
 		 364 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2088  hypothetical protein  58.01 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.450369 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1945  hypothetical protein  58.38 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1890  hypothetical protein  59.82 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.133556  normal  0.775497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1895  hypothetical protein  64.51 
 
 		 332 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1851  hypothetical protein  56.69 
 
 		 386 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000802  hypothetical protein  37.54 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135693  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06701  hypothetical protein  37.54 
 
 		 361 aa  240  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0874  hypothetical protein  38.48 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00736429  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0276  hypothetical protein  56.19 
 
 		 140 aa  123  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0277  hypothetical protein  34.21 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>