236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2126 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  81.06 
 
 		 396 aa  681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  82.83 
 
 		 396 aa  705    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  82.83 
 
 		 396 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  77.06 
 
 		 401 aa  658    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1750  aromatic amino acid aminotransferase  87.63 
 
 		 396 aa  735    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.270408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  83.33 
 
 		 396 aa  705    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000566266  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  80.05 
 
 		 397 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  82.58 
 
 		 396 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  82.58 
 
 		 396 aa  704    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2126  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 396 aa  823    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.621421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  82.58 
 
 		 396 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1733  aromatic amino acid aminotransferase  77.78 
 
 		 396 aa  656    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162633  hitchhiker  0.000702513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  83.08 
 
 		 396 aa  704    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  0.00000000000361956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  77.06 
 
 		 401 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  83.33 
 
 		 396 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  82.07 
 
 		 396 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4970  aromatic amino acid aminotransferase  68.69 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1232  aromatic amino acid aminotransferase  54.66 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01010  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 		 396 aa  444  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00165068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3552  aromatic amino acid aminotransferase  50.13 
 
 		 398 aa  421  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.0997527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1320  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 396 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4016  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 397 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  49.87 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  49.24 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  49.24 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  49.24 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  47.47 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  48.23 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 397 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  47.98 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  46.46 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  47.73 
 
 		 396 aa  391  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1497  aromatic amino acid aminotransferase  47.97 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  47.98 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3114  aromatic amino acid aminotransferase  47.97 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.384285 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0407  aromatic amino acid aminotransferase  45.2 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.761548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53010  aromatic amino acid aminotransferase  48.22 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4646  aromatic amino acid aminotransferase  47.97 
 
 		 399 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0630  aromatic amino acid aminotransferase  45.71 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  45.09 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  46.48 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0225  aromatic amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 398 aa  368  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  44.95 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05719  aromatic amino acid aminotransferase  43.8 
 
 		 398 aa  362  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000111  aspartate aminotransferase  44.56 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  43.43 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  42.93 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  43.32 
 
 		 397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  43.32 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  43.32 
 
 		 397 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0789  aromatic amino acid aminotransferase  45.13 
 
 		 395 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  43.58 
 
 		 399 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2280  aromatic amino acid aminotransferase  43.18 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2635  aromatic amino acid aminotransferase  45.29 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.574688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0121  aromatic amino acid aminotransferase  44.7 
 
 		 406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0447  aromatic amino acid aminotransferase  42.28 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4592  aromatic amino acid aminotransferase  43.07 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  43.43 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7524  aromatic amino acid aminotransferase  43.54 
 
 		 394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4643  aromatic amino acid aminotransferase  43.07 
 
 		 397 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.319396  normal  0.236394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1557  aromatic amino acid aminotransferase  42.93 
 
 		 398 aa  352  8.999999999999999e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  44.95 
 
 		 402 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1403  aromatic amino acid aminotransferase  43.11 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000415206  normal  0.0752089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>