More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2102 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  68.08 
 
 		 218 aa  308  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  66.82 
 
 		 218 aa  295  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  64.93 
 
 		 218 aa  292  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  58.14 
 
 		 216 aa  270  9e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  59.07 
 
 		 218 aa  264  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  54.88 
 
 		 216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  56.81 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  51.46 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  47.42 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  43.46 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  29.11 
 
 		 245 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  27.83 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  26.37 
 
 		 489 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  27.36 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  27.36 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  29.94 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  29.65 
 
 		 600 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  25.63 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.5 
 
 		 381 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  26.2 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  25.89 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  26.29 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  25.62 
 
 		 449 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  26.57 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  26.57 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  25.97 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.6 
 
 		 332 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  25.94 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  24.5 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  25.59 
 
 		 521 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  24.06 
 
 		 386 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  24.88 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  24.88 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  26.67 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  31.01 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  24.4 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  24.88 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  24.61 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  27.73 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  24.88 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  27.98 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  26.07 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  27.73 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  25.29 
 
 		 576 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  24.88 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  27.12 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  20.41 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  26.29 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  27.75 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 		 567 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  21.88 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  24.73 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  26.64 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  25.24 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  26.11 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  26.18 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  26.35 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  24.59 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  27.54 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  23.94 
 
 		 607 aa  60.1  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  30.25 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  21.67 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  25.63 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  25.63 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  27.55 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  28.78 
 
 		 844 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  28.88 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  27.17 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  23.88 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  26.54 
 
 		 440 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  27.49 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  28.32 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  27.64 
 
 		 825 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  27.64 
 
 		 825 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  27.64 
 
 		 862 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  27.64 
 
 		 825 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  27.64 
 
 		 825 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  27.64 
 
 		 825 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  27.64 
 
 		 825 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  22.11 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  25.49 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 		 483 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  23.12 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  25.49 
 
 		 961 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  23.3 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  25.26 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  25.79 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  25.67 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  27.12 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  26.7 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  28.48 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>