241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2024 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  78.59 
 
 		 397 aa  673    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  74.81 
 
 		 397 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  79.85 
 
 		 397 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  80.35 
 
 		 397 aa  682    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  74.81 
 
 		 397 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  80.35 
 
 		 397 aa  680    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  80.35 
 
 		 397 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  80.35 
 
 		 397 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 397 aa  818    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  80.1 
 
 		 397 aa  680    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  79.85 
 
 		 397 aa  676    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  79.6 
 
 		 397 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  76.07 
 
 		 397 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  79.6 
 
 		 397 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  73.8 
 
 		 398 aa  634    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  73.55 
 
 		 397 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  74.56 
 
 		 397 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  65.24 
 
 		 399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  64.14 
 
 		 396 aa  551  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  63.38 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  63.38 
 
 		 396 aa  541  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  60.35 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  61.36 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  60.35 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  60.35 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  60.35 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  60.35 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  61.36 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  60.35 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  61.36 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  60.35 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  62.37 
 
 		 396 aa  534  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  60.35 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  60.1 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  60.1 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  60.1 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  60.1 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  60.1 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  60.61 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  61.11 
 
 		 401 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  60.61 
 
 		 396 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  62.47 
 
 		 411 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 		 396 aa  512  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 		 398 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  60.1 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  56.57 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0407  aromatic amino acid aminotransferase  55.3 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.761548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 396 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 		 402 aa  428  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2126  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 396 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.621421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  51.52 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  0.00000000000361956 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1750  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 		 396 aa  418  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.270408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000566266  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3552  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.0997527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4970  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1320  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  49.63 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 399 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1733  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162633  hitchhiker  0.000702513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  48.38 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1232  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  47.98 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  50.13 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  47.47 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 398 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  49.24 
 
 		 398 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 		 398 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  49.87 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  46.46 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  46.46 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>