121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1944 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  82.98 
 
 
234 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  80 
 
 
234 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  78.11 
 
 
234 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  61.28 
 
 
267 aa  318  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  65.53 
 
 
234 aa  315  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  67.78 
 
 
239 aa  315  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  65.96 
 
 
239 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  66.38 
 
 
239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  65.96 
 
 
234 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  65.53 
 
 
239 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  55.83 
 
 
240 aa  249  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  38.98 
 
 
221 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  34.04 
 
 
242 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  32.52 
 
 
234 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  32.03 
 
 
240 aa  91.7  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  31.02 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  31.06 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  32.31 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  31.06 
 
 
240 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  31.06 
 
 
240 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  32.88 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  30.54 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  30.42 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  30.54 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  30.54 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  31.12 
 
 
229 aa  82  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  39.5 
 
 
245 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  41.18 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  41.67 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  33.49 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  43.52 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  43.52 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  43.52 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  42.06 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  43.52 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  35.71 
 
 
256 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  31.67 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  45.37 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  40.27 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  45.37 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  45.37 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  36.31 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  43.52 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  37.82 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  37.93 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  49.37 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  39.25 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  37.59 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  44.21 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  40.2 
 
 
228 aa  72  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  33.65 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  36 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  36 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  38.68 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  42.24 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  37.98 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  37.4 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  38.33 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  35.14 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  33.56 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  33.08 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  27.41 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  31.94 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  31.94 
 
 
271 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  34.13 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  28.63 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  25.53 
 
 
219 aa  64.3  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  27.03 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  27.03 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  30.09 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4388  hypothetical protein  28.33 
 
 
248 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  27.59 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  40.45 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  31.3 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  32.87 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  42.05 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  28.8 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  28.33 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  26.84 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  28.33 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  43.02 
 
 
272 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  27.9 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  27.39 
 
 
249 aa  62  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3348  hypothetical protein  28.14 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00245935  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  39.53 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  27.97 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  31.85 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  32.45 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  27.04 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  34.07 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  28.65 
 
 
265 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  31.68 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  34.07 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  32.76 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  31.75 
 
 
323 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>