More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1812 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  793    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  71.07 
 
 		 401 aa  600  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  63.88 
 
 		 456 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  66.08 
 
 		 400 aa  544  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  67.08 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  62.19 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  61.35 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  61.35 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  65.25 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  59.55 
 
 		 403 aa  491  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  59.95 
 
 		 402 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  59.85 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  58.06 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  59.7 
 
 		 400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  59.2 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  55.47 
 
 		 401 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  56.47 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  56.47 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  56.72 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  47.52 
 
 		 409 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  48.77 
 
 		 409 aa  362  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  48.28 
 
 		 409 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  48.03 
 
 		 409 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  45.27 
 
 		 408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  40.8 
 
 		 406 aa  332  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  46.93 
 
 		 409 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  46.93 
 
 		 409 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  46.68 
 
 		 409 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  41.54 
 
 		 406 aa  325  7e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  45.91 
 
 		 409 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  42.96 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  42.75 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  44.86 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  45.19 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  40.3 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  44.67 
 
 		 404 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  46.68 
 
 		 408 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  40.45 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  39.51 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  42.11 
 
 		 406 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  45.64 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  44.9 
 
 		 406 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  44.22 
 
 		 391 aa  293  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  40.86 
 
 		 658 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  39.8 
 
 		 647 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  42.15 
 
 		 707 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  40.25 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  41.27 
 
 		 661 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  36.78 
 
 		 715 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  38.71 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  43.43 
 
 		 670 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  40.8 
 
 		 657 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  40.1 
 
 		 656 aa  275  8e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  38.92 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  39 
 
 		 651 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  40.55 
 
 		 671 aa  272  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  39.47 
 
 		 412 aa  272  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  42.68 
 
 		 657 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  40.6 
 
 		 653 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  38.75 
 
 		 644 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  41.38 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  38.15 
 
 		 657 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  39.36 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  39.26 
 
 		 407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  38.39 
 
 		 443 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  38.69 
 
 		 652 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  38.56 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  37.56 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  40.91 
 
 		 657 aa  263  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  38.04 
 
 		 649 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  40.2 
 
 		 410 aa  262  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  38.9 
 
 		 656 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 		 409 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  39.9 
 
 		 663 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  38.82 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  39.8 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  38.57 
 
 		 410 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  39.5 
 
 		 653 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  39.41 
 
 		 663 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  40.94 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  38.56 
 
 		 405 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  38.44 
 
 		 418 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 		 654 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  35.54 
 
 		 454 aa  255  9e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  39.85 
 
 		 423 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  37.13 
 
 		 405 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  36.48 
 
 		 678 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.48 
 
 		 678 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  36.88 
 
 		 405 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  38.12 
 
 		 657 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  38.54 
 
 		 650 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  36.48 
 
 		 678 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  38.46 
 
 		 409 aa  250  3e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  39.85 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  39.85 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  37.03 
 
 		 652 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  38.79 
 
 		 656 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  38.5 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  36.97 
 
 		 404 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  37.22 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>