More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1763 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 282 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  43.92 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  43.87 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  43.87 
 
 		 276 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  42.45 
 
 		 276 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  43.12 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  41.16 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  39.86 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  41.85 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  38.41 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  40.3 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  40 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 275 aa  205  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  34.8 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  32.01 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.85 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.85 
 
 		 372 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.85 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  33.09 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  33.33 
 
 		 238 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.2 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.94 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.84 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 273 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.87 
 
 		 283 aa  92.8  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.68 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.26 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.95 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.84 
 
 		 392 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 282 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.86 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  24.01 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.4 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  24.61 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  23.74 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  27 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  24.53 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.04 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  29.03 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  25.18 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>