211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1737 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1737  septum formation inhibitor  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  74.66 
 
 		 221 aa  342  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  70 
 
 		 221 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000361193  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  70 
 
 		 221 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  70 
 
 		 221 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  70 
 
 		 221 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000124722  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  69.55 
 
 		 221 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  67.73 
 
 		 221 aa  308  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  70.59 
 
 		 236 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  68.18 
 
 		 221 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  68.18 
 
 		 221 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  68.18 
 
 		 221 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  64.25 
 
 		 221 aa  289  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2114  septum formation inhibitor  66.52 
 
 		 221 aa  288  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000440493  normal  0.228236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  67.27 
 
 		 221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  66.37 
 
 		 224 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000656846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01386  septum formation inhibitor  44.39 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004086  septum site-determining protein MinC  43.93 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000371161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1545  septum formation inhibitor  43.78 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000716221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  43.06 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  40.74 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  40.91 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  37.23 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  37.23 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  39.91 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  39.91 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  37.23 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  37.23 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  39.91 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  37.23 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2006  septum formation inhibitor  43.07 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  39.22 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1067  septum formation inhibitor  42.66 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00667924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  37.02 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  37.02 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  37.02 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  37.02 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  37.02 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1329  septum formation inhibitor  36.36 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000408843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1973  septum formation inhibitor  36.36 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000684881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1661  septum formation inhibitor  36.36 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000772871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1320  septum formation inhibitor  36.36 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000146927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2756  septum formation inhibitor  38.03 
 
 		 233 aa  154  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000039542  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  37.82 
 
 		 235 aa  151  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1077  septum site-determining protein MinC  39.48 
 
 		 233 aa  148  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00582076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0444  septum formation inhibitor  34.89 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.66341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  38.6 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  34.02 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  35.83 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  36.09 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3345  septum site-determining protein MinC  34.17 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  36.49 
 
 		 244 aa  134  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  36.28 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  35.53 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  36.91 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  35.55 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  34.93 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  34.93 
 
 		 263 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  34.88 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  33.2 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  36.4 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  36.49 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  34.48 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  32.79 
 
 		 255 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  32.79 
 
 		 255 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  34.88 
 
 		 246 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  34.48 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  36.53 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1164  septum site-determining protein MinC  36 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238053  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  32.89 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  34.13 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  38.61 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  33.91 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  32.23 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  35.8 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  32.46 
 
 		 261 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  32.64 
 
 		 242 aa  117  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  33.48 
 
 		 248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0009  septum site-determining protein MinC  33.8 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.274749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0067  septum site-determining protein MinC  29.84 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5650  septum formation inhibitor  37.21 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  30.74 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6586  septum formation inhibitor  36.02 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249532 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4340  septum formation inhibitor  32.79 
 
 		 262 aa  111  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.255105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0020  septum site-determining protein MinC  33.48 
 
 		 265 aa  111  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.973742  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3376  septum formation inhibitor  32.89 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  35.47 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  36.46 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1838  septum site-determining protein MinC  30.65 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2036  septum site-determining protein MinC  31.05 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0501  septum formation inhibitor  30.74 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0711428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2970  septum formation inhibitor  32.05 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0124  septum site-determining protein MinC  33.06 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  32.1 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1992  septum formation inhibitor  32.43 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0091  septum site-determining protein MinC  30 
 
 		 271 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  30.27 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  30.27 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  30.27 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0632  septum site-determining protein MinC  34.58 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>