119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1726 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1726  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  100 
 
 		 76 aa  150  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3191  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  56.58 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0111  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  59.21 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4075  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.58 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1869  hypothetical protein  52.7 
 
 		 193 aa  90.9  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383251  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3817  redox-active disulfide protein 2  58.9 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1646  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  53.95 
 
 		 77 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1222  redox-active disulfide protein 2  58.9 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1811  redox-active disulfide protein 2  60.53 
 
 		 76 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1829  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  53.95 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813005  normal  0.88262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1429  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  53.95 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3416  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  50 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369553  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2332  redox-active disulfide protein 2  57.53 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.650672  normal  0.0752191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1934  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  52.63 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4599  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  51.32 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81041  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1475  redox-active disulfide protein 2  52.78 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2843  glutaredoxin  50.68 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.486982  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0588  redox-active disulfide protein 2  51.32 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2948  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  46.05 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.960362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3642  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  50.68 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0535  redox-active disulfide protein 2  46.05 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3496  redox-active disulfide protein 2  46.05 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3356  redox-active disulfide protein 2  48.68 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4203  putative glutaredoxin family protein/Thio-disulfide isomerase  50.68 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0487  redox-active disulfide protein 2  50.68 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0536  redox-active disulfide protein 2  44.74 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0399  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11443  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0462  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000236165  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3831  redox-active disulfide protein 2  47.37 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3957  redox-active disulfide protein 2  47.37 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3775  redox-active disulfide protein 2  47.37 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0702  redox-active disulfide protein 2  47.3 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.94898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3943  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46.05 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0493  redox-active disulfide protein 2  47.37 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3420  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46.05 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2025  redox-active disulfide protein 2  45.83 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1856  redox-active disulfide protein 2  46.58 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3619  redox-active disulfide protein 2  39.73 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3598  redox-active disulfide protein 2  47.95 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.420898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2554  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 		 80 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000309431  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1903  redox-active disulfide protein 2  49.28 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.76321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1620  redox-active disulfide protein 2  38.36 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1093  hypothetical protein  55.74 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000000590144  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0894  redox-active disulfide protein 2  45.95 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3660  redox-active disulfide protein 2  46.38 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0508  redox-active disulfide protein 2  41.67 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_878  redox-active disulfide protein 2  45.71 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.895707  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0176  redox-active disulfide protein 2  44.12 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4061  redox-active disulfide protein 2  47.89 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  0.892222 
 
 
-
 
NC_002936  DET1007  redox-active disulfide protein 2  47.14 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00309602  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2047  redox-active disulfide protein 2  47.83 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1116  redox-active disulfide protein 2  38.16 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0856  redox-active disulfide protein 2  45.21 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1324  redox-active disulfide protein 2  44.74 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3674  redox-active disulfide protein 2  38.36 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.766727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1705  redox-active disulfide protein 2  40.58 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1624  redox-active disulfide protein 2  43.48 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000124454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2641  redox-active disulfide protein 2  47.62 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2564  redox-active disulfide protein 2  49.23 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000509192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1300  redox-active disulfide protein 2  49.23 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1409  hypothetical protein  53.52 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.34966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1708  redox-active disulfide protein 2  32.88 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1907  redox-active disulfide protein 2  42.11 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0881518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0943  redox-active disulfide protein 2  38.36 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0546  redox-active disulfide protein 2  46.97 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0586  redox-active disulfide protein 2  46.97 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4282  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1484  redox-active disulfide protein 2  44.93 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.591966  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0750  redox-active disulfide protein 2  48.61 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0155  hypothetical protein  42.47 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1877  redox-active disulfide protein 2  50.82 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1782  redox-active disulfide protein 2  41.1 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.889289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5315  redox-active disulfide protein 2  43.94 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31849  normal  0.0964369 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0752  redox-active disulfide protein 2  39.73 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2350  redox-active disulfide protein 2  46.38 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.4313  hitchhiker  0.00041608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3835  redox-active disulfide protein 2  46.38 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0827  redox-active disulfide protein 2  43.66 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000837608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4013  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3389  hypothetical protein  36.99 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3336  redox-active disulfide protein 2  38.16 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2180  redox-active disulfide protein 2  47.54 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000368742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0818  redox-active disulfide protein 2  44.44 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519826  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0730  redox-active disulfide protein 2  45.9 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000429418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1710  hypothetical protein  36.99 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0068017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1322  redox-active disulfide protein 2  42.47 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0185  putative thioredoxin  38.16 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2778  redox-active disulfide protein 2  36.99 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1211  redox-active disulfide protein 2  47.83 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2073  redox-active disulfide protein 2  42.47 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2878  redox-active disulfide protein 2  45.21 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1749  redox-active disulfide protein 2  38.03 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0327584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1803  redox-active disulfide protein 2  38.03 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1067  redox-active disulfide protein 2  53.97 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1684  redox-active disulfide protein 2  40.58 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.465445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0264  redox-active disulfide protein 2  34.78 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20080  redox-active disulfide protein 2  38.16 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1205  redox-active disulfide protein 2  39.13 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0336  hypothetical protein  42.42 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1221  redox-active disulfide protein 2  46.55 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1184  redox-active disulfide protein 2  41.43 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>