More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1630 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  77.95 
 
 		 585 aa  911    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  79.13 
 
 		 585 aa  927    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  77.95 
 
 		 585 aa  911    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  77.95 
 
 		 585 aa  911    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  69 
 
 		 592 aa  778    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  58.05 
 
 		 579 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  58.05 
 
 		 579 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  78.46 
 
 		 590 aa  912    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  77.95 
 
 		 585 aa  911    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  81.21 
 
 		 578 aa  939    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  70.47 
 
 		 576 aa  840    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  77.82 
 
 		 585 aa  913    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  77.99 
 
 		 585 aa  910    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  100 
 
 		 600 aa  1209    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  66.26 
 
 		 591 aa  764    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  71.94 
 
 		 592 aa  811    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  78.56 
 
 		 585 aa  916    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  58.08 
 
 		 567 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  40.96 
 
 		 578 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  42.75 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  42.75 
 
 		 568 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  42.75 
 
 		 568 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  42.94 
 
 		 573 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  44.16 
 
 		 569 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  36.16 
 
 		 560 aa  332  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  33.71 
 
 		 565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  33.75 
 
 		 574 aa  299  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  33.96 
 
 		 575 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  34.68 
 
 		 575 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  34.66 
 
 		 590 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  33.89 
 
 		 605 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  34.59 
 
 		 583 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  32.35 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  35.1 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  33.65 
 
 		 595 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  33.52 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  33.02 
 
 		 580 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  35.55 
 
 		 590 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  34.22 
 
 		 570 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  36.38 
 
 		 587 aa  266  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  34.03 
 
 		 570 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  35.62 
 
 		 566 aa  265  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  33.78 
 
 		 596 aa  264  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  34.22 
 
 		 570 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  31.1 
 
 		 569 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  31.1 
 
 		 569 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  35.02 
 
 		 559 aa  260  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  35.15 
 
 		 574 aa  259  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  34.61 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  35.07 
 
 		 556 aa  257  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  32.58 
 
 		 582 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  32.66 
 
 		 586 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  32.42 
 
 		 571 aa  254  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.15 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.15 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  33.15 
 
 		 610 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.15 
 
 		 610 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  33.15 
 
 		 610 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.15 
 
 		 610 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.15 
 
 		 610 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  34.18 
 
 		 572 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  32.04 
 
 		 569 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  33.88 
 
 		 557 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  30.97 
 
 		 567 aa  230  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  29.69 
 
 		 584 aa  230  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  30.81 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  30.05 
 
 		 588 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  32.26 
 
 		 563 aa  228  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  30.98 
 
 		 591 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  29.13 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  34.22 
 
 		 573 aa  224  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  33.21 
 
 		 550 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  32.49 
 
 		 570 aa  213  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  31.47 
 
 		 605 aa  213  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  29.97 
 
 		 585 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  30.02 
 
 		 574 aa  210  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  29.69 
 
 		 575 aa  210  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  33.15 
 
 		 581 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  29.66 
 
 		 583 aa  209  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  28.06 
 
 		 565 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  28.89 
 
 		 565 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  30.98 
 
 		 558 aa  204  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  29.51 
 
 		 585 aa  204  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  29.25 
 
 		 570 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  28.85 
 
 		 566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  28.31 
 
 		 572 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  27.5 
 
 		 574 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  26.68 
 
 		 571 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  27.85 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  33.33 
 
 		 576 aa  198  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  28.55 
 
 		 578 aa  198  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  32.08 
 
 		 558 aa  194  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  31.17 
 
 		 577 aa  194  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  31.2 
 
 		 599 aa  194  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  28.44 
 
 		 585 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  28.01 
 
 		 730 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4477  sulphate transporter  30.29 
 
 		 624 aa  193  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.496082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  31.19 
 
 		 586 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3792  sulphate transporter  31.55 
 
 		 619 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4576  sulphate transporter  31.55 
 
 		 572 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>