121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1410 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3055  proline iminopeptidase  73.29 
 
 		 424 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2227  alpha/beta hydrolase fold  76.69 
 
 		 429 aa  700    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1434  prolyl aminopeptidase 2  70.63 
 
 		 429 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1499  prolyl aminopeptidase 2  70.4 
 
 		 429 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1410  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 454 aa  943    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1492  prolyl aminopeptidase 2  71.33 
 
 		 429 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2735  alpha/beta hydrolase fold  71.33 
 
 		 429 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2270  alpha/beta hydrolase fold  71.39 
 
 		 429 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.201892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2429  alpha/beta hydrolase fold  69.7 
 
 		 429 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2752  alpha/beta hydrolase fold  71.1 
 
 		 429 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1661  alpha/beta hydrolase fold  70.4 
 
 		 429 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.485679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1634  alpha/beta hydrolase fold  72.94 
 
 		 433 aa  661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2828  alpha/beta hydrolase fold  71.1 
 
 		 429 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1624  alpha/beta hydrolase fold protein  70.63 
 
 		 429 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.610603  normal  0.321544 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  69.37 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2143  alpha/beta hydrolase fold  68.63 
 
 		 439 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001130  putative prolyl aminopeptidase  53.43 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.047339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2072  alpha/beta hydrolase fold  47.85 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2021  putative proline iminopeptidase  45.15 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3689  putative prolyl aminopeptidase  45.84 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  46.88 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  43.97 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  43.16 
 
 		 412 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0398  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167053  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2460  alpha/beta hydrolase fold  42.34 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4559  prolyl aminopeptidase 2  41.67 
 
 		 421 aa  342  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6521  alpha/beta hydrolase fold protein  41.59 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.17034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06790  prolyl aminopeptidase 2  42.06 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0642789 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02092  Putative prolyl aminopeptidase Fragment (EC 3.4.11.5) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT1]  40.9 
 
 		 443 aa  303  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.707401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05870  prolyl aminopeptidase 2  39.17 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208476  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33188  predicted protein  37.77 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0134  alpha/beta hydrolase fold protein  39.33 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11240  hypothetical protein with alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.163814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4714  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  37.67 
 
 		 460 aa  270  5e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00350  prolyl aminopeptidase 2  36.96 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0669  putative hydrolse  37.03 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272037  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  32.04 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47448  predicted protein  31.49 
 
 		 692 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  26.04 
 
 		 540 aa  53.5  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  26.17 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  23.8 
 
 		 546 aa  50.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  30.38 
 
 		 323 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  34.26 
 
 		 335 aa  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  29.17 
 
 		 323 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  30.38 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  25 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  26.52 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  30.38 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  26.47 
 
 		 323 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  25.5 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  27.38 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  27.38 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 		 535 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 		 535 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  25.28 
 
 		 527 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  30.77 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  30.71 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  26.86 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  27.54 
 
 		 271 aa  47.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  28.18 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  23.86 
 
 		 291 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  31.67 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1352  proline iminopeptidase  33.33 
 
 		 312 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.800954 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  27.27 
 
 		 313 aa  47.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  28.21 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  24.38 
 
 		 303 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  24.38 
 
 		 301 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  30.77 
 
 		 311 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  24.38 
 
 		 301 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  24.38 
 
 		 301 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  31.76 
 
 		 308 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  33.71 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  29.2 
 
 		 323 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  33.71 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  28.21 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  26.4 
 
 		 291 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  26.29 
 
 		 539 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  32.41 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  26.47 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  31.4 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  25.6 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  31.09 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  28.67 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  27.46 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  28.67 
 
 		 316 aa  45.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  25.17 
 
 		 313 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  31.97 
 
 		 320 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2466  prolyl aminopeptidase  36.23 
 
 		 346 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  30.25 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  28.67 
 
 		 316 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  27.52 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  28.89 
 
 		 539 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  33.05 
 
 		 319 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>