48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1355 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  74.54 
 
 		 274 aa  440  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  75.28 
 
 		 274 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  75.28 
 
 		 274 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  74.91 
 
 		 274 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  73.9 
 
 		 273 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  73.9 
 
 		 273 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  73.9 
 
 		 273 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  73.9 
 
 		 273 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  73.06 
 
 		 274 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  69.49 
 
 		 272 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  70.48 
 
 		 273 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  66.42 
 
 		 271 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  66.91 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  66.91 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  66.42 
 
 		 273 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  65.43 
 
 		 275 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  66.17 
 
 		 274 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  62.45 
 
 		 265 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  57.76 
 
 		 283 aa  347  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2068  hypothetical protein  50.56 
 
 		 278 aa  298  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0821949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  50.56 
 
 		 277 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  50.74 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  50.38 
 
 		 266 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  51.57 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  49.81 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  49.44 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  49.44 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  50.79 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3440  hypothetical protein  48.71 
 
 		 280 aa  280  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  50.78 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  51.35 
 
 		 266 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  50.97 
 
 		 266 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  47.78 
 
 		 275 aa  274  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  48.31 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01647  hypothetical protein  46.52 
 
 		 279 aa  268  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  45.15 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  45.15 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  36.67 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00660  hypothetical protein  38.83 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.26692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1714  hypothetical protein  35.42 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0366  hypothetical protein  35.09 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0036321  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2784  hypothetical protein  25.69 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  27.23 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  25.26 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  21.58 
 
 		 251 aa  45.4  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0400  hypothetical protein  24.62 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  25.4 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>