75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1346 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  50 
 
 		 302 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  44.59 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  40.62 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  43.97 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  43.69 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  44.03 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.29 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  44 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  41.44 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  42.57 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  41.1 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  40.13 
 
 		 285 aa  205  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  45.73 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  42.62 
 
 		 289 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  39.8 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  43.34 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  43.96 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  41.39 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  41.53 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  44.67 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  37.76 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  44.33 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  39.26 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  42.24 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  43.99 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  36.52 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  39.02 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  40.14 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.14 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  43.2 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  41.52 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  41.67 
 
 		 285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  38.96 
 
 		 288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  37.41 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  35.19 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  43.88 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  41.87 
 
 		 194 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  45.96 
 
 		 281 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.95 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  38.65 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.9 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  26.97 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  26.97 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  27.14 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  23.25 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  29.26 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.81 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  25.09 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  27.46 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  25.69 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  25.09 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  26.34 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  27.76 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  23.71 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  24.08 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  23.95 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  29.2 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  22.38 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  24.06 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  23.58 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.33 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  24.26 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  24.87 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  22.64 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>