262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1290 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
364 aa  763    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  62.4 
 
 
369 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  55.92 
 
 
363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
381 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  40.44 
 
 
365 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  40.44 
 
 
365 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  42.58 
 
 
367 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  41.32 
 
 
368 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  40.61 
 
 
382 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.5 
 
 
371 aa  276  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  37.53 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 
389 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  40 
 
 
364 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 
364 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
381 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  38.44 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  36.74 
 
 
396 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
368 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
429 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2799  hypothetical protein  37.63 
 
 
194 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  42.66 
 
 
158 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
154 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
154 aa  97.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 
146 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.422971  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 
188 aa  89.4  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  35.37 
 
 
176 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.46 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961517  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  40.2 
 
 
109 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  39.46 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.89 
 
 
170 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.41 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.47 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.01 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.11 
 
 
165 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.35 
 
 
156 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.39 
 
 
159 aa  67.8  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.25 
 
 
139 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
170 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  37.67 
 
 
159 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.758103  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
171 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.53 
 
 
162 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.43 
 
 
150 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 
178 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3165  hypothetical protein  20.56 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0328  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.03 
 
 
189 aa  62  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0227  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.79 
 
 
161 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1322  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.79 
 
 
161 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  31.03 
 
 
160 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.21 
 
 
152 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0867  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.71 
 
 
144 aa  60.8  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.77 
 
 
153 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2462  hypothetical protein  24.71 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2648  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.14 
 
 
154 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.528414  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0187  acetyltransferase  34.69 
 
 
138 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.046026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.46 
 
 
163 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  32.67 
 
 
145 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.1 
 
 
161 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126445  normal  0.618144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1867  ribosomal protein (S18)-alanine acetyltransferase  31.76 
 
 
150 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.216572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.78 
 
 
153 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0185  putative acetyltransferase  30.33 
 
 
145 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0958  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.28 
 
 
173 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452906 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.03 
 
 
156 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
161 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  32.67 
 
 
145 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.74 
 
 
179 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  32.67 
 
 
141 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  26.64 
 
 
212 aa  56.6  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0621  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
294 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.77 
 
 
152 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
169 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  31.37 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2685  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.5 
 
 
157 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  31.37 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  31.37 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.99 
 
 
170 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  32.29 
 
 
141 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  32.29 
 
 
141 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  32.29 
 
 
141 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  32.29 
 
 
141 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  32.29 
 
 
141 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.12 
 
 
175 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.35 
 
 
173 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
153 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.03 
 
 
161 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.469186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.71 
 
 
181 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  32.29 
 
 
141 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2597  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.61 
 
 
165 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.65 
 
 
152 aa  53.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.56 
 
 
160 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.21 
 
 
148 aa  53.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1218  acetyltransferase  30.15 
 
 
155 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.065696  normal  0.121515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.17 
 
 
147 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2240  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
237 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  31.25 
 
 
141 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.47 
 
 
148 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  31.25 
 
 
141 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  31.25 
 
 
141 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>