280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1194 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 267 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  82.77 
 
 		 267 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  77.19 
 
 		 265 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  76.81 
 
 		 265 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  77.57 
 
 		 265 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  76.05 
 
 		 265 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  79.17 
 
 		 265 aa  424  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  76.81 
 
 		 265 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  76.81 
 
 		 265 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  76.43 
 
 		 265 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  76.81 
 
 		 265 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  75.29 
 
 		 265 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  79.47 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  72.52 
 
 		 262 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  70.94 
 
 		 266 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  74.41 
 
 		 261 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  51.41 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  47.81 
 
 		 260 aa  258  9e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  50.2 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  46.69 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  49.4 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  48.19 
 
 		 260 aa  235  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  46.83 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  43.88 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  44.4 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  45.57 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  47.6 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  42.55 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  46.38 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  41.86 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  43.53 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  42.75 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  43.8 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  41.7 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  40.85 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  40.43 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  43.42 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  38.82 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  38.29 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  41.3 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  38.8 
 
 		 247 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  40.51 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  39.06 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  37.5 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  38.33 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  41.78 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  36.93 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  40.61 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  36.93 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  33.88 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  34.16 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  36.21 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  36.84 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  38.05 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  37.86 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  35.44 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  34.84 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  34.84 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  34.84 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  38.5 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  37.04 
 
 		 264 aa  151  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  33.06 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  36.65 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  34.02 
 
 		 256 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  34.02 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  35.96 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  36.44 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  33.61 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  36.07 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  35.66 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  35.66 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  37.18 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  37.61 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  34.31 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  36.75 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  36.75 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  36.75 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  36.75 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  36.75 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  36.75 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  35.95 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  35.02 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  35.02 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  37.25 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  33.03 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  32.6 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  33.49 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1653  flagellar biosynthetic protein FliR  38.4 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.314291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  38.05 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  37.26 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  38.05 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  35.96 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  35.53 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  35.53 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  35.53 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  35.53 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  31.97 
 
 		 253 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  33.94 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  33.77 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  32.63 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>