More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1173 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
481 aa  922  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  96.88 
 
 
482 aa  833  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  57.31 
 
 
484 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  57.31 
 
 
485 aa  454  1e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  54.49 
 
 
467 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  53.27 
 
 
468 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  48.39 
 
 
488 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  48.58 
 
 
516 aa  359  7e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  46.76 
 
 
483 aa  356  4e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  46.61 
 
 
492 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  46.31 
 
 
517 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  43.76 
 
 
492 aa  337  4e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  46.25 
 
 
475 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  45.71 
 
 
493 aa  321  1e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  42.63 
 
 
497 aa  322  1e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  45.71 
 
 
475 aa  321  2e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  44.12 
 
 
501 aa  305  1e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  43.08 
 
 
494 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  42.72 
 
 
492 aa  296  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  43.96 
 
 
490 aa  293  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  41.05 
 
 
493 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  1.74414e-05 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  41.05 
 
 
493 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  44.38 
 
 
492 aa  284  3e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  73.4 
 
 
393 aa  283  7e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  39.72 
 
 
498 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  72.41 
 
 
394 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  40.19 
 
 
506 aa  276  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  41.9 
 
 
472 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  42.35 
 
 
486 aa  271  3e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  41.43 
 
 
471 aa  271  3e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  41.96 
 
 
462 aa  269  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  39.64 
 
 
488 aa  254  4e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  37.03 
 
 
493 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  36.83 
 
 
505 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  38.37 
 
 
506 aa  235  1e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  38.37 
 
 
506 aa  235  1e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  37.7 
 
 
506 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  37.82 
 
 
492 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  36.43 
 
 
505 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  36.36 
 
 
469 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  43.1 
 
 
687 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  38.1 
 
 
498 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  64.77 
 
 
379 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  46.33 
 
 
377 aa  222  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  59.79 
 
 
387 aa  221  2e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  45.79 
 
 
609 aa  221  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  65.84 
 
 
375 aa  220  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  63.01 
 
 
377 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  63.01 
 
 
377 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  36.17 
 
 
420 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  63.01 
 
 
377 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  65.22 
 
 
376 aa  217  3e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  65.22 
 
 
402 aa  217  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  64.6 
 
 
376 aa  216  6e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  54.29 
 
 
377 aa  216  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  64.71 
 
 
271 aa  215  2e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  64.71 
 
 
271 aa  215  2e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  57.98 
 
 
378 aa  213  4e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  59.14 
 
 
272 aa  213  8e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  61.85 
 
 
377 aa  213  8e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  57.81 
 
 
377 aa  213  8e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  59.14 
 
 
272 aa  213  8e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  65.84 
 
 
271 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  51.72 
 
 
377 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  65.84 
 
 
271 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  57.81 
 
 
377 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  63.53 
 
 
271 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  63.53 
 
 
271 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  64.37 
 
 
379 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  37.3 
 
 
481 aa  208  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  63.25 
 
 
270 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  34.35 
 
 
390 aa  207  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  57.47 
 
 
385 aa  207  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  60.12 
 
 
384 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  63.58 
 
 
275 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  54.45 
 
 
378 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  63.58 
 
 
274 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  62.96 
 
 
275 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  63.25 
 
 
294 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  64.2 
 
 
273 aa  203  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  62.96 
 
 
273 aa  201  2e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  62.96 
 
 
274 aa  201  2e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  65.22 
 
 
376 aa  200  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  60 
 
 
271 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  57.45 
 
 
272 aa  199  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  58.96 
 
 
384 aa  199  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  63.58 
 
 
273 aa  198  1e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  43.49 
 
 
580 aa  198  1e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  60.61 
 
 
273 aa  199  1e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  61.21 
 
 
272 aa  198  2e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  61.59 
 
 
276 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  63.35 
 
 
294 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  51.81 
 
 
388 aa  196  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0568  flagellin B  32.05 
 
 
496 aa  196  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  38.65 
 
 
412 aa  196  8e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  60.48 
 
 
273 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  59.39 
 
 
272 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  48.4 
 
 
404 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  59.28 
 
 
272 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  54.79 
 
 
273 aa  193  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>