More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1071 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  71.94 
 
 
950 aa  1404  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  70.63 
 
 
949 aa  1395  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  72.16 
 
 
950 aa  1410  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
943 aa  1956  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  47.97 
 
 
952 aa  880  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  49.37 
 
 
950 aa  937  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  70.2 
 
 
949 aa  1386  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  71.41 
 
 
944 aa  1409  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  68.23 
 
 
945 aa  1373  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  72.16 
 
 
944 aa  1411  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  70.41 
 
 
949 aa  1392  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  48.02 
 
 
947 aa  910  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  52.27 
 
 
958 aa  1040  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  69.11 
 
 
974 aa  1366  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  53.87 
 
 
945 aa  1023  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  72.23 
 
 
944 aa  1411  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  46.82 
 
 
947 aa  879  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  72.16 
 
 
950 aa  1409  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  69.82 
 
 
944 aa  1395  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  68.39 
 
 
945 aa  1365  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  54.56 
 
 
959 aa  1037  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  50.05 
 
 
969 aa  908  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  70.46 
 
 
949 aa  1392  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  70.88 
 
 
944 aa  1401  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  36.33 
 
 
954 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  34.32 
 
 
921 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  34.61 
 
 
947 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  34.32 
 
 
949 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  34.32 
 
 
929 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  32.86 
 
 
943 aa  472  1e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  32.37 
 
 
962 aa  440  1e-122  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  32.19 
 
 
960 aa  440  1e-122  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  33.3 
 
 
930 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  32.77 
 
 
959 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  32.31 
 
 
956 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  32.57 
 
 
949 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  32.01 
 
 
967 aa  409  1e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  31.43 
 
 
952 aa  407  1e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  29.65 
 
 
910 aa  393  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  30.95 
 
 
903 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  30.77 
 
 
901 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  30.77 
 
 
904 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  40.91 
 
 
458 aa  327  8e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  40.91 
 
 
458 aa  327  8e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  41.19 
 
 
458 aa  327  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.18 
 
 
954 aa  321  4e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.78 
 
 
896 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.55 
 
 
937 aa  281  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.02 
 
 
945 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  25.98 
 
 
929 aa  279  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  27.34 
 
 
918 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
440 aa  266  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  27.43 
 
 
934 aa  260  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  36.97 
 
 
470 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  32.73 
 
 
440 aa  251  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  33.57 
 
 
422 aa  249  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  35.08 
 
 
429 aa  240  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  24.97 
 
 
876 aa  238  5e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  26.01 
 
 
919 aa  237  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  33.89 
 
 
442 aa  236  2e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  32.96 
 
 
447 aa  235  4e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  36.43 
 
 
429 aa  234  7e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  38.48 
 
 
423 aa  228  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  27.37 
 
 
949 aa  228  5e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  33.49 
 
 
452 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  34.07 
 
 
411 aa  216  2e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  31.74 
 
 
453 aa  215  3e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.48 
 
 
853 aa  215  3e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  32.38 
 
 
470 aa  213  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  26.36 
 
 
921 aa  212  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  32.86 
 
 
448 aa  209  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  24.1 
 
 
912 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  36.91 
 
 
413 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  32.7 
 
 
427 aa  209  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
461 aa  208  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  32.62 
 
 
443 aa  207  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  30.77 
 
 
450 aa  208  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  32.77 
 
 
428 aa  208  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  32.54 
 
 
443 aa  207  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  25.09 
 
 
928 aa  206  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  33.65 
 
 
443 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  30.77 
 
 
450 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  32.85 
 
 
443 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  32.61 
 
 
443 aa  205  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  33.68 
 
 
464 aa  205  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  24.73 
 
 
948 aa  204  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  32.85 
 
 
443 aa  204  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  33.87 
 
 
463 aa  204  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  32.85 
 
 
443 aa  204  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  31.03 
 
 
457 aa  204  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  35.06 
 
 
461 aa  204  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  25.72 
 
 
912 aa  203  1e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  32.37 
 
 
443 aa  202  2e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  29.95 
 
 
465 aa  202  2e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  29.95 
 
 
465 aa  202  2e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  32.37 
 
 
443 aa  202  2e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  33.97 
 
 
461 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  32.37 
 
 
443 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  30.8 
 
 
457 aa  202  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  30.86 
 
 
453 aa  201  4e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>