More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1058 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1058  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1122  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  83.41 
 
 
211 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  82.94 
 
 
211 aa  363  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.968624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1192  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  82.94 
 
 
211 aa  363  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3434  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  81.04 
 
 
211 aa  359  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1202  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  81.99 
 
 
211 aa  355  2e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00210603  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3273  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  78.67 
 
 
211 aa  348  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2751  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  79.15 
 
 
211 aa  349  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1042  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  78.67 
 
 
211 aa  347  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1243  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  78.2 
 
 
211 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.485227  hitchhiker  6.49527e-11 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  78.2 
 
 
211 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  78.2 
 
 
211 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3344  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  76.78 
 
 
211 aa  343  9e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110739  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1296  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  72.51 
 
 
211 aa  335  3e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36531e-09 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1191  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  74.88 
 
 
211 aa  333  8e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  73.93 
 
 
216 aa  331  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3861  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  64.29 
 
 
212 aa  279  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03724  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  61.54 
 
 
211 aa  262  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.32477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1076  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  63 
 
 
216 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  62.5 
 
 
208 aa  259  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.2 
 
 
208 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03519  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  60.2 
 
 
208 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0927  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.37 
 
 
218 aa  244  5e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002514  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.18 
 
 
208 aa  244  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  58.71 
 
 
208 aa  242  2e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  58.71 
 
 
208 aa  242  2e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  58.71 
 
 
208 aa  242  2e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.73 
 
 
208 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.73 
 
 
208 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.73 
 
 
208 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.73 
 
 
208 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.73 
 
 
208 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.71 
 
 
208 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3023  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.11 
 
 
224 aa  239  3e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  2.7014e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.71 
 
 
208 aa  238  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0839  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.72 
 
 
208 aa  237  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.649779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.77 
 
 
208 aa  235  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.77 
 
 
208 aa  235  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.77 
 
 
208 aa  235  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.77 
 
 
208 aa  235  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.77 
 
 
208 aa  235  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  55.77 
 
 
208 aa  235  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.77 
 
 
208 aa  235  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.77 
 
 
208 aa  235  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.77 
 
 
208 aa  235  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.72 
 
 
208 aa  235  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1515  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.16 
 
 
222 aa  235  5e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2508  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57 
 
 
208 aa  234  9e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.44 
 
 
225 aa  233  2e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491382  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.94 
 
 
211 aa  233  2e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.93 
 
 
225 aa  231  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12772  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.81 
 
 
208 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1563  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.44 
 
 
211 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4054  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.39 
 
 
225 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.617904  hitchhiker  2.46992e-06 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1433  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.68 
 
 
221 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0886457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4156  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.41 
 
 
224 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1621  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.41 
 
 
231 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1175  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.41 
 
 
224 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334554  normal  0.339213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38700  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.65 
 
 
226 aa  219  2e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1828  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.73 
 
 
221 aa  214  6e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1250  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  52.48 
 
 
223 aa  213  1e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.424545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1430  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.5 
 
 
220 aa  209  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2419  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.5 
 
 
219 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1287  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.5 
 
 
221 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  50.95 
 
 
213 aa  199  2e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.745112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00164  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.48 
 
 
225 aa  197  1e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0650575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1825  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.25 
 
 
223 aa  196  2e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.175242  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2634  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.5 
 
 
229 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1459  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.99 
 
 
225 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1993  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  51.49 
 
 
210 aa  191  9e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1919  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.99 
 
 
225 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.837211  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0836  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  50.49 
 
 
226 aa  188  6e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214261  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3032  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.76 
 
 
222 aa  187  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.51 
 
 
220 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0547  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.02 
 
 
259 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1256  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.47 
 
 
232 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.228462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2609  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.25 
 
 
220 aa  183  2e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2523  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  48 
 
 
216 aa  181  9e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.84795e-08  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1298  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.04 
 
 
218 aa  178  6e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.075528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3016  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.27 
 
 
215 aa  177  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0496  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.73 
 
 
211 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.26 
 
 
225 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3113  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.73 
 
 
218 aa  175  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2684  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.46 
 
 
206 aa  174  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0261  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.67 
 
 
217 aa  174  1e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  6.51087e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.32 
 
 
217 aa  173  1e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49 
 
 
219 aa  173  2e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.41 
 
 
221 aa  172  2e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.94 
 
 
228 aa  173  2e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1556  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.46 
 
 
206 aa  172  3e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5028  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.85 
 
 
247 aa  172  4e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0656  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.55 
 
 
218 aa  172  4e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.861145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1205  hypothetical protein  45.62 
 
 
321 aa  172  4e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.31 
 
 
232 aa  171  6e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2738  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.97 
 
 
215 aa  171  8e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2117  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.51 
 
 
302 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391815  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.5 
 
 
217 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2411e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1734  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.98 
 
 
216 aa  170  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5883  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
218 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.98 
 
 
657 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>