72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1018 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 892 aa  1723    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  38.92 
 
 		 1316 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  33.44 
 
 		 1281 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  36.18 
 
 		 905 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  35.09 
 
 		 799 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.4 
 
 		 752 aa  253  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  38.66 
 
 		 526 aa  243  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  35.1 
 
 		 572 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  36.05 
 
 		 575 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  35.8 
 
 		 575 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  31.44 
 
 		 466 aa  168  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  26.92 
 
 		 1361 aa  161  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  28.35 
 
 		 449 aa  148  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  26.66 
 
 		 1279 aa  147  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  27.18 
 
 		 1180 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0842  putative surface protein  29.22 
 
 		 649 aa  121  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  28.73 
 
 		 657 aa  118  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.59 
 
 		 1776 aa  112  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1183 aa  105  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  37.24 
 
 		 316 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  31.84 
 
 		 412 aa  101  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1700 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  28.32 
 
 		 4630 aa  99.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  33.62 
 
 		 678 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  25.8 
 
 		 1300 aa  96.3  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  34.41 
 
 		 258 aa  90.9  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  43.48 
 
 		 739 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  33.61 
 
 		 810 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  34.65 
 
 		 410 aa  87.8  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  40.97 
 
 		 201 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  41.38 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  32.66 
 
 		 374 aa  80.1  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  40.83 
 
 		 688 aa  80.1  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  40.52 
 
 		 631 aa  77.8  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  31.76 
 
 		 368 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 220 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  41.38 
 
 		 595 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  51.39 
 
 		 648 aa  74.7  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  37.93 
 
 		 486 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  32.29 
 
 		 981 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  36.2 
 
 		 1048 aa  65.1  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  26.55 
 
 		 2042 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  32.21 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  30 
 
 		 1821 aa  61.2  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  27.84 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  42.11 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  40.82 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  42.39 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  30.65 
 
 		 1245 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  36.49 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  36.51 
 
 		 1009 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25 
 
 		 12684 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  26.16 
 
 		 331 aa  55.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  25.97 
 
 		 2172 aa  55.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  32.43 
 
 		 472 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  28.71 
 
 		 472 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  39.5 
 
 		 924 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  42.47 
 
 		 683 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  36.26 
 
 		 1737 aa  52.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  37.21 
 
 		 932 aa  52  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  26.01 
 
 		 390 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  26.67 
 
 		 651 aa  50.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  25.12 
 
 		 2638 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  24.1 
 
 		 466 aa  50.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  36.3 
 
 		 1421 aa  48.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  27.17 
 
 		 1732 aa  47.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1806  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.45 
 
 		 2177 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  23.14 
 
 		 392 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3550  Ig domain protein group 2 domain protein  31.19 
 
 		 436 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  47.27 
 
 		 1965 aa  46.2  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  25.85 
 
 		 14944 aa  45.8  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  34.13 
 
 		 462 aa  44.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>