94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0940 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 541 aa  1100    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  46.77 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  45.29 
 
 		 504 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  43.71 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  40.87 
 
 		 522 aa  405  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  41.78 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  24.68 
 
 		 542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  20.32 
 
 		 512 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  19.52 
 
 		 501 aa  87.4  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  23.49 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  20.56 
 
 		 561 aa  73.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  20.53 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  21.47 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  22.57 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  20.79 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  19.81 
 
 		 472 aa  67  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  20 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.12 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  20.65 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.46 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  22.22 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  21.78 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  22.48 
 
 		 527 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  20.28 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  23.53 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  21.31 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  20.84 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  19.91 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  20.28 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  20.14 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  20.05 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  26.83 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  20.13 
 
 		 575 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.59 
 
 		 480 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  20.51 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  20.51 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  19.9 
 
 		 467 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  19.35 
 
 		 634 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  20.51 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  20.51 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  18.2 
 
 		 632 aa  55.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  20.51 
 
 		 486 aa  54.3  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  21.38 
 
 		 511 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  21.68 
 
 		 516 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  33 
 
 		 169 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  24.28 
 
 		 575 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  23.53 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  28.8 
 
 		 174 aa  52.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  20 
 
 		 609 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  18.63 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  27.22 
 
 		 180 aa  52  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  30.34 
 
 		 508 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  27.27 
 
 		 643 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  30.69 
 
 		 163 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  30.69 
 
 		 163 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  28.86 
 
 		 587 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  23.6 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.63 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  28.32 
 
 		 579 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  19.7 
 
 		 472 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  19.7 
 
 		 472 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  27.07 
 
 		 255 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  28.09 
 
 		 555 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  21.84 
 
 		 489 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 		 159 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  25.47 
 
 		 161 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  19.83 
 
 		 547 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  24.72 
 
 		 166 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  28.74 
 
 		 532 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  30.99 
 
 		 170 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  19.94 
 
 		 646 aa  46.2  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  28.7 
 
 		 242 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  26.09 
 
 		 158 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  26.09 
 
 		 158 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  27.78 
 
 		 186 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  26.85 
 
 		 203 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  29.58 
 
 		 766 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  30.53 
 
 		 179 aa  45.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  25.96 
 
 		 530 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  27.55 
 
 		 158 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  23.71 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  27.55 
 
 		 158 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  27.55 
 
 		 158 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  27.55 
 
 		 158 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  27.55 
 
 		 158 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  26.32 
 
 		 203 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  29.17 
 
 		 186 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  27.55 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  25.74 
 
 		 539 aa  44.3  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  21.96 
 
 		 483 aa  43.9  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  20.69 
 
 		 443 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  26.32 
 
 		 228 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  27.35 
 
 		 192 aa  43.9  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>