95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0935 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  216  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  61.17 
 
 		 101 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  63.11 
 
 		 102 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  63.11 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  61.17 
 
 		 101 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  60.58 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  62.14 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  60.19 
 
 		 101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  61.17 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  60.19 
 
 		 101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  57.28 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  53.4 
 
 		 103 aa  123  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  55.56 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  55.88 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  63.95 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  54.72 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  51.76 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  50.59 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  59.46 
 
 		 81 aa  91.3  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  62.5 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  60.29 
 
 		 79 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  45 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  60.29 
 
 		 79 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  60.29 
 
 		 79 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  60.29 
 
 		 79 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  51.19 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  61.29 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  60.94 
 
 		 125 aa  85.9  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  43.81 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  56.25 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  56.25 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  42.86 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  45.68 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  41.18 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  47.46 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  41.18 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  52.38 
 
 		 285 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  41.82 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  33.77 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  42.22 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  34.29 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  42.22 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  48.78 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  38.71 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  39.29 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  33.9 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  42.22 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  32.79 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  48.84 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1608  hypothetical protein  64.29 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1905  hypothetical protein  64.29 
 
 		 50 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1535  hypothetical protein  64.29 
 
 		 50 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0662033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1548  hypothetical protein  64.29 
 
 		 50 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1736  hypothetical protein  64.29 
 
 		 50 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.122671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  44.19 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.78 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  44 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  59.38 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  39.22 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  36.54 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  58.82 
 
 		 202 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  43.18 
 
 		 110 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  36 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 92 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 		 72 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  37.25 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  42.86 
 
 		 248 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  35.85 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  35.29 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  32.86 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  32.86 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  32.86 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  31.94 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  31.94 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  31.43 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  31.94 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  31.94 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  32.79 
 
 		 89 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  41.38 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>