60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0934 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  58.24 
 
 		 178 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  58.24 
 
 		 178 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  58.24 
 
 		 178 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  57.06 
 
 		 178 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  54.04 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  58.75 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  54.44 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  53.85 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  53.85 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  54.44 
 
 		 175 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  48.12 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  55.56 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0875  hypothetical protein  57.76 
 
 		 184 aa  148  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000548389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  50.58 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  33.14 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  30.17 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  28.11 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  31.28 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  28.82 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  28.43 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  26.34 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  25.29 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  24.86 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  26.09 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  27.84 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  27.87 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  23.37 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3296  hypothetical protein  46.15 
 
 		 55 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.766582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0993  hypothetical protein  43.64 
 
 		 55 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  26.63 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  25.71 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  26.06 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  24.86 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  26.47 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  25.27 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  25.14 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  25.14 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  25.14 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  29.65 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  25.14 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1577  hypothetical protein  24.74 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  25.7 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  25.57 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  25.14 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  22.83 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  25.88 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  25.93 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  24.2 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  25.29 
 
 		 189 aa  42  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  23.42 
 
 		 189 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  21.76 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>