More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0898 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  473  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  93.42 
 
 		 246 aa  440  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  93.42 
 
 		 246 aa  440  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  93.42 
 
 		 246 aa  440  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  92.48 
 
 		 246 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  91.15 
 
 		 246 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  90.27 
 
 		 247 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  90.27 
 
 		 247 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  90.27 
 
 		 246 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  90.35 
 
 		 253 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  90.27 
 
 		 247 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  90.67 
 
 		 263 aa  424  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  90.31 
 
 		 240 aa  424  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  89.78 
 
 		 240 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  89.13 
 
 		 243 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  83.04 
 
 		 230 aa  394  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  71.12 
 
 		 241 aa  340  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  66.23 
 
 		 253 aa  338  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  67.78 
 
 		 247 aa  334  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  70.78 
 
 		 233 aa  330  9e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  55.61 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  50.87 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  55.71 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  52.78 
 
 		 220 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  53.42 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  53.42 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  51.39 
 
 		 220 aa  244  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50.91 
 
 		 225 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 		 241 aa  243  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 		 244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  53.67 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  52.27 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  51.36 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.92 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.35 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  48.15 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50.92 
 
 		 237 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  50.68 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  48.89 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 226 aa  232  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.4 
 
 		 239 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.32 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50.92 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.61 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  49.54 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.83 
 
 		 258 aa  228  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.66 
 
 		 238 aa  228  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  49.54 
 
 		 239 aa  227  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.22 
 
 		 260 aa  224  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  49.77 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  48.4 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  50.68 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  45.18 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  50 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 222 aa  222  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.55 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 		 226 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  49.77 
 
 		 225 aa  221  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.73 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  47.27 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  47.27 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  47.69 
 
 		 244 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47.09 
 
 		 230 aa  221  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  49.54 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  50.23 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48.62 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  49.32 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.17 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.17 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  49.08 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  47.25 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>