44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0870 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  100 
 
 		 384 aa  786    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  38.52 
 
 		 379 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  35.43 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  30.81 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  35.34 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  34.69 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  36.03 
 
 		 240 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  36.03 
 
 		 240 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  36.03 
 
 		 240 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  36.3 
 
 		 240 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  36.3 
 
 		 240 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  36.3 
 
 		 240 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  36.3 
 
 		 240 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  36.3 
 
 		 240 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  36.3 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  36.3 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  35.56 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  34.07 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  34.27 
 
 		 277 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  31.82 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  32.62 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  32.33 
 
 		 758 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  32.06 
 
 		 727 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  32.35 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  28.95 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  35.61 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  34.19 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  30.46 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  30.46 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  29.22 
 
 		 262 aa  53.5  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  30.37 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0603  lipase, class 3  28.79 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  31.78 
 
 		 641 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  27.07 
 
 		 276 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  29.75 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  30.83 
 
 		 324 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5346  lipase class 3  32.26 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  24.15 
 
 		 271 aa  46.2  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  35.24 
 
 		 336 aa  46.2  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50397  predicted protein  24.9 
 
 		 891 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2662  lipase class 3  30.26 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.631826 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  24.68 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60390  triacylglycerol lipase  26.63 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>