More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0806 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.46 
 
 
208 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.46 
 
 
208 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  60.98 
 
 
208 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.49 
 
 
208 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  61.17 
 
 
205 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  58.62 
 
 
205 aa  259  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  60.78 
 
 
205 aa  255  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.85 
 
 
209 aa  232  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  55.12 
 
 
209 aa  221  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  52.2 
 
 
209 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  51.67 
 
 
206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  54.85 
 
 
211 aa  210  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.78 
 
 
208 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  46.57 
 
 
208 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  46.08 
 
 
208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.46 
 
 
208 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  45.5 
 
 
226 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  44.5 
 
 
208 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  41.55 
 
 
222 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  43.93 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  43.81 
 
 
208 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.31 
 
 
222 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.31 
 
 
222 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.18 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.18 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  40.18 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  40.65 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  42.79 
 
 
224 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  42.72 
 
 
214 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  42.25 
 
 
214 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  42.42 
 
 
208 aa  168  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  41.12 
 
 
225 aa  167  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.45 
 
 
220 aa  167  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  39.73 
 
 
221 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  38.71 
 
 
222 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  38.71 
 
 
222 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  38.97 
 
 
222 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  36.79 
 
 
220 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  37.56 
 
 
222 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  38.68 
 
 
218 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  37.79 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  39.44 
 
 
218 aa  151  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  36.59 
 
 
215 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.44 
 
 
218 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 
222 aa  147  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  36.24 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  36.87 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.5 
 
 
221 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  36.53 
 
 
222 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.05 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  33.95 
 
 
221 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  37.05 
 
 
232 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.65 
 
 
121 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  37.73 
 
 
229 aa  138  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.52 
 
 
221 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  37.9 
 
 
227 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0374  glutathione S-transferase-like protein  54.46 
 
 
120 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.31 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  36.19 
 
 
221 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.5 
 
 
229 aa  124  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  34.15 
 
 
213 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  34.72 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.85 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.93 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  31.84 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 
202 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  35.19 
 
 
222 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  35.19 
 
 
222 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  35.19 
 
 
222 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  35.19 
 
 
222 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  35.19 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  34.72 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  50.93 
 
 
124 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
217 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  36.04 
 
 
245 aa  105  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  32.69 
 
 
214 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.35 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  29.91 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  31.25 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
202 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  30.69 
 
 
201 aa  94  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  30.73 
 
 
202 aa  92  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  30.29 
 
 
216 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  28.5 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  29.38 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  29.19 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  31.68 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  27.88 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  29.91 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  31.53 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  29.52 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  28 
 
 
225 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.72 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  30.29 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>